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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002785`

染色体: Chr04 坐标: 43654775-43655403 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002785`
名称	SmilChr04G002785
描述	uncharacterized SmilChr04G002785
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	43654775 - 43655403 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021879`
GeneID	`131021879`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021879`
原始查询	`SmilChr04G002785`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=22.9; qcov=0.947; evalue=8.17e-08; confidence=weak
Rice	`Os01g0595300` - identity=27.2; qcov=0.967; evalue=4.44e-11; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021879

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807188.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807188.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807188.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807188.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057807188.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:43655009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr4:43655012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr4:43655035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr4:43655079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B79
`Chr4:43655107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B65,B91,C71
`Chr4:43655107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,B91,C71
`Chr4:43655112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C74
`Chr4:43655112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr4:43655172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B28
`Chr4:43655211`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B105,C9
`Chr4:43655211`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B105,C9
`Chr4:43655249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B115,B89,C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807188.1

152 aa

152

SWIM

PF04434 SWIM 12-42 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807188.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	12	42	3.1e-08	33.7	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951205.1
TTGAGTGGCATGAAGTATAAGGTGCAAACTGCTGACAGAAGCTTCAAGGTGGATCTGGAGAAGAAAAAATGCGTATGTCGAGTATTTCAGCTAGACCAACTGCCCTGTTCTCATTCAATCGCTGCAATAAGTGAAGCCGGTGATACGATCGCGGAGTATGTAGACTCGTACTACACGAATGACTTTCTTATCGATACTTACTCTCGCGAAGTTAATAATCTCCCACCGAGACGCCAGTGGTTGGTTCCCGAGCACATCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021879
ATGAAGTATAAGGTGCAAACTGCTGACAGAAGCTTCAAGGTGGATCTGGAGAAGAAAAAATGCGTATGTCGAGTATTTCAGCTAGACCAACTGCCCTGTTCTCATTCAATCGCTGCAATAAGTGAAGCCGGTGATACGATCGCGGAGTATGTAGACTCGTACTACACGAATGACTTTCTTATCGATACTTACTCTCGCGAAGTTAATAATCTCCCACCGAGACGCCAGTGGTTGGTTCCCGAGCACATCGCTGAGCAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807188.1
MKYKVQTADRSFKVDLEKKKCVCRVFQLDQLPCSHSIAAISEAGDTIAEYVDSYYTNDFLIDTYSREVNNLPPRRQWLVPEHIAEQVVLLLIVKGQAGRPKEGRHRGGGEGSNTQADESSSIRRRKPKKCSICHEEGHSKRTCAGRATEPRE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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