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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002806`

染色体: Chr04 坐标: 43982875-43987599 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002806`
名称	SmilChr04G002806
描述	transcription repressor KAN1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	43982875 - 43987599 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021924`
GeneID	`131021924`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021924`
原始查询	`SmilChr04G002806`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription repressor KAN1-like
产物	transcription repressor KAN1-like
Arabidopsis	`AT5G16560` (KAN) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831518] identity=43.1; qcov=0.978; evalue=2.4e-58; confidence=medium
Rice	`Os09g0395300` (RL9) - identity=57.9; qcov=0.497; evalue=4.28e-50; confidence=medium
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0010158 (abaxial cell fate specification)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021924

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807247.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807247.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807247.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807247.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057807247.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:43985257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr4:43986529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,B82,C60
`Chr4:43986560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr4:43986600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr4:43986618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C58
`Chr4:43986827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,C11,C69
`Chr4:43986993`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	156	A1,A10,A11,A14,A16,A23,A24,A25,A3,A4,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B108,B109,B11,B110,B111,B113,B117,B118,B12,B124,B125,B126,B127,B129,B130,B132,B133,B134,B137,B139,B18,B21,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B33,B34,B35,B37,B4,B41,B42,B43,B46,B47,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B6,B60,B62,B64,B66,B68,B69,B7,B72,B73,B75,B76,B77,B78,B80,B83,B84,B85,B88,B89,B90,B91,B93,B94,B98,B99,C1,C12,C13,C15,C16,C19,C20,C22,C23,C24,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C35,C36,C37,C38,C4,C40,C41,C45,C46,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C55,C56,C57,C59,C6,C64,C66,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C79,C80,C81,C82,C9,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr4:43986997`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	157	A1,A10,A11,A14,A16,A19,A23,A24,A25,A3,A4,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B102,B103,B104,B105,B108,B109,B11,B110,B111,B113,B117,B118,B12,B124,B126,B127,B129,B130,B132,B133,B134,B137,B139,B18,B21,B22,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B33,B34,B35,B37,B4,B41,B42,B43,B46,B47,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B60,B62,B64,B66,B68,B69,B7,B72,B73,B75,B76,B77,B78,B80,B81,B83,B84,B85,B88,B89,B90,B91,B93,B94,B98,B99,C1,C12,C13,C16,C18,C19,C20,C22,C23,C24,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C35,C36,C37,C38,C4,C40,C41,C45,C46,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C55,C56,C57,C59,C6,C62,C64,C66,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C79,C80,C81,C82,C9,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr4:43987002`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A7,B132,B35,B55,B90,B93,C23,C4,C7,C75,C82,C9
`Chr4:43987003`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	38	A11,A14,A19,A23,A6,B103,B108,B109,B11,B110,B124,B129,B22,B46,B50,B54,B57,B62,B72,B73,B81,B89,B94,C20,C37,C41,C50,C6,C66,C7,C71,C77,C79,C82,C9,D11,D3,D9
`Chr4:43987007`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	57	A23,A24,A5,A8,B100,B106,B107,B108,B112,B115,B121,B13,B140,B15,B17,B2,B38,B39,B40,B44,B48,B49,B52,B56,B57,B59,B64,B65,B70,B78,B79,B86,B87,B89,B91,B96,C19,C2,C21,C35,C42,C46,C54,C55,C58,C60,C63,C65,C69,C71,C77,C78,C80,C81,C86,C87,D9
`Chr4:43987012`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	45	A22,A24,B10,B100,B104,B108,B112,B121,B136,B139,B2,B38,B39,B40,B44,B52,B57,B59,B64,B65,B86,B87,B89,B91,C11,C13,C14,C19,C2,C21,C27,C42,C46,C49,C55,C58,C69,C71,C77,C78,C81,C83,C86,D11,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807247.1

368 aa

184

368

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 222-273 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807247.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	222	273	3.2e-06	27.9	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951264.1
TGTGTGTAATAAAAAGTTAGAGAGAGAAGCGAAGAGGGTGGGGGGAAAAGAATCACAGAAGAGGGTTAACTTTCTGTGTCAAGAATTTTAACCCGTCGACTACGGGGAAGGAAATCAAAAAGTGGGCATATATCTTTTGTGTTAAATGAAAAAAAATACAGTATATGTTTGGTTTTGAAAATGAATTATATAATTGGTTTTGACTAGCGAGTCATGAGAGAAAATGCCTAGTTCTGATGTCATTTTCCAAGATATACTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021924
ATGCTCAAGATCTTGATTTGTTCCACATCTTTAACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAAAAGATGCCCTTGTTGGAGGCTGGCTCAGTTCCAGTTCCTGATCTGTCTCTGAACATCAGCCCACCAAACTGCGAAATCAACTCGACGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAAGTCCAAGAGCTCCTTCACGGAGCTGTCGTTGGCCCACCCGGCCAACCACGAAATCGAGCTGGAGAAGAGCTTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807247.1
MLKILICSTSLTREREREREREREKKKMPLLEAGSVPVPDLSLNISPPNCEINSTSSSSSSKSKSSFTELSLAHPANHEIELEKSFNGGCRQNPFLMNHGESPSSESDGLRPIKGIPVYPNRPFPFLGLDKDPKMRYYQMPYPSPPSPYFVGAALDHHMPMLNLGPSSPPAPYRAGRFNAAAYPAHLYGIGPSSHETSHHGIMRSSRFLPKLPAKRSMRAPRMRWTSTLHSRFVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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