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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002808`

染色体: Chr04 坐标: 44009669-44011722 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002808`
名称	SmilChr04G002808
描述	probable inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 5, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	44009669 - 44011722 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021940`
GeneID	`131021940`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021940`
原始查询	`SmilChr04G002808`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 5, chloroplastic
产物	probable inactive ATP-dependent zinc metalloprotease FTSHI 5%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G04340` (emb2458) FtsH extracellular protease family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819589] identity=70.8; qcov=0.807; evalue=9.43e-42; confidence=medium
Rice	`Os12g0145400` (OsTBL23) - identity=52.6; qcov=0.319; evalue=1.67e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021940

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807266.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057807266.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807266.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807266.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807266.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:44010537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A18,B110,B16,B6,B8,B88,C22,C67
`Chr4:44010905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,B43,B7,B76
`Chr4:44011556`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B123
`Chr4:44011556`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B123
`Chr4:44011563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr4:44011589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,B7,D11
`Chr4:44011599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B96,C36
`Chr4:44011611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,C41,D8
`Chr4:44011618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,C34,C40,C82,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951283.1
ATTTTTTCTACAGAGTATCTTGTGATTAAGTAGATTATCATGTAGATTTATTGACGCGTGCTTGATAATTTCTGATCATGATATTTGCTGGATACAATAAAGCTATCAGAATTTTTGAGGTTCATCGCCCAGGGAGAGATTTTGAAAAACACTCGACTGTTTTAGGAAACAAAGAAGGCCAATCAGACTTTCAGCCCCTTGGTCCCTAGATGGGTGGGGAAAACCAAAATTGCGAAGTGAATAAGCAAGATGATAGTAAA...

XM_057951284.1
TTTCTGATCATGTCTGTTTTTTTCTTTGCCCCTGAATCCAGATCTCTGTCTTTTTTGGTTTTAAGTCTTTGCCTTATGATAGTCCTATGTCTTTCAGGAACTTCTGTTTTTCACACATGTAGCTATTTTGTATATTTGAAGATATTATATTATTCTGATCAGGATATTTGCTGGATACAATAAAGCTATCAGAATTTTTGAGGTTCATCGCCCAGGGAGAGATTTTGAAAAACACTCGACTGTTTTAGGAAACAAAGAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021940
ATGATAGTAAAACATCTTGATCTGACATTGACAAAAGAGGATTTGCAGGATGTTGTTGACCTAATGGAACCATATGGTCAAATAAACAATGGAATAGAACTGCTAAGTCCACCTCTTGATTGGACTAGGGAGACAAAATTTCCCCATACAGTCTGGGCTGTTGGCCGTGGTCTCATAGCTCTTCTGTTACCAAACTTTGATGTTGTTGATAACCTTTGGCTTGAACCTTCTTCTTGGGAGGGATGTTACTTTCAGAAAGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807266.1
MIVKHLDLTLTKEDLQDVVDLMEPYGQINNGIELLSPPLDWTRETKFPHTVWAVGRGLIALLLPNFDVVDNLWLEPSSWEGCYFQKGRKIKMEMSAKEAFERSMRTLSEWISQEVNRNM

XP_057807267.1
MIVKHLDLTLTKEDLQDVVDLMEPYGQINNGIELLSPPLDWTRETKFPHTVWAVGRGLIALLLPNFDVVDNLWLEPSSWEGCYFQKGRKIKMEMSAKEAFERSMRTLSEWISQEVNRNM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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