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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002809`

染色体: Chr04 坐标: 44036052-44036576 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002809`
名称	SmilChr04G002809
描述	uncharacterized SmilChr04G002809
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	44036052 - 44036576 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023481`
GeneID	`131023481`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023481`
原始查询	`SmilChr04G002809`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=26.3; qcov=0.764; evalue=1.88e-10; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=26.5; qcov=0.845; evalue=1.04e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023481

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057809008.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057809008.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057809008.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057809008.1`
5	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057809008.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:44036065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B131,B2
`Chr4:44036078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr4:44036084`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A20,A23,A3,A7,B11,B127,B22,B56,B86,B96,C27,C46,C48,C53,C76
`Chr4:44036119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B131
`Chr4:44036120`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C25
`Chr4:44036120`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C25
`Chr4:44036181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B113,B20,B50,B57,C15,C18,C27,C55,D4
`Chr4:44036186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C9,D8
`Chr4:44036211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr4:44036225`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	55	A1,A18,A19,A3,B10,B103,B107,B109,B11,B115,B119,B120,B127,B132,B14,B140,B17,B2,B27,B28,B30,B36,B37,B44,B56,B6,B60,B71,B74,B87,B89,B98,B99,C13,C17,C23,C24,C25,C26,C29,C3,C33,C38,C5,C52,C54,C58,C7,C71,C76,C78,C79,C85,C87,D1
`Chr4:44036244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B1,B140,C65,C87
`Chr4:44036244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B140,C65,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809008.1

174 aa

174

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 3-70 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809008.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	3	70	4.1e-15	56.9	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953025.1
ATGCTTAACTCGGTCTGGAAGGCAAAGGCACCACAGAAAGCTATTATGACAGCCTGGAGGGTGCTGAAAAACCGTATCCCGACCTGCGATAATTTGAGGAAAAGACAGGTTCCGTTGTGCGAAGAAGACACCAAATGTAAAGAATGCGGAATGCAAGAAGAATCAGCCTATCATGTTTTCCTGGCATGCCCAAAGATGGAGGAGGCGTGGAACGATTTGCAGAAATGGCTGGGAACTGCTACGGTACGACCAAACTCGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023481
ATGCTTAACTCGGTCTGGAAGGCAAAGGCACCACAGAAAGCTATTATGACAGCCTGGAGGGTGCTGAAAAACCGTATCCCGACCTGCGATAATTTGAGGAAAAGACAGGTTCCGTTGTGCGAAGAAGACACCAAATGTAAAGAATGCGGAATGCAAGAAGAATCAGCCTATCATGTTTTCCTGGCATGCCCAAAGATGGAGGAGGCGTGGAACGATTTGCAGAAATGGCTGGGAACTGCTACGGTACGACCAAACTCGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809008.1
MLNSVWKAKAPQKAIMTAWRVLKNRIPTCDNLRKRQVPLCEEDTKCKECGMQEESAYHVFLACPKMEEAWNDLQKWLGTATVRPNSIESHFGTFAAFGKEKKVKNLLLAIWVCCIWLLWKKRNEKRFEYKEWDPKKLVMEVKIRMWSWNRIFGIVEDVSNLDSWCADKFVPRMM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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