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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002817`

染色体: Chr04 坐标: 44228394-44229297 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002817`
名称	SmilChr04G002817
描述	ethylene-response factor C3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	44228394 - 44229297 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021933`
GeneID	`131021933`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021933`
原始查询	`SmilChr04G002817`

查看完整 ID 对照表

已核对的文献基因名映射

这些条目来自人工核对的文献基因名与当前参考基因组的映射。置信度反映映射证据强度，不代表该功能已在本材料中完成实验验证。

文献基因名	映射置信度	映射证据	文献功能摘要
`SmERF1b-like`	high	BLASTN/BLASTX against website CDS/protein; 97.41% nucleotide identity, 100% query coverage	Regulates tanshinone biosynthesis.

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ethylene-response factor C3-like
产物	ethylene-response factor C3-like
Arabidopsis	`AT3G23240` (ERF1) ethylene response factor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821902] identity=55.2; qcov=0.766; evalue=4.33e-41; confidence=medium
Rice	`Os03g0860100` (OsERF#083) - identity=47.6; qcov=0.851; evalue=1.7e-36; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009873 (ethylene-activated signaling pathway)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021933

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807259.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807259.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807259.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807259.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057807259.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:44228583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:44228871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,C11,C69
`Chr4:44228966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807259.1

175 aa

175

AP2

PF00847 AP2 42-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807259.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	42	92	1.5e-14	54.8	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951276.1
TACAGCTTTTTGTAGCCTGGAACGCTGAAATTTTAAATTTCACTCTCATAATTGGCCTTAGAAAAAGAAAAAAAAAAACCCCAAAATTCCATATATGGATGAAGCCAGGAAATACAAGTTGTCGACGAATCTAGCATCTCAATAATCTAAGAAAAGTAATCTAAAAAAAAGTCTTCTCTCTCCTCACCATTTGAGTACTTGACATAATTTGTAATTTAGAGGTGAATTATGAGATGGAGTCAGAGTCATGTTGGGCTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021933
ATGGAGTCAGAGTCATGTTGGGCTTTCAAAGAAGAAAATCTAATGTCATTTAAAATGTGTACATCACAAGAATCTGAAGCAGAAGCTGAGGCGTCCAACATCAATCGTGCAGATGTAGAAAAACGATACATTGGAGTAAGAAAGAGGCCATGGGGGAAATATGCAGCAGAAATTAGGGATTCCACACGGCATGGAGCGAGGGTTTGGCTGGGCACATTCAACACCGCGGAAGAGGCTGCTTTAGCGTATGATCAAGCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807259.1
MESESCWAFKEENLMSFKMCTSQESEAEAEASNINRADVEKRYIGVRKRPWGKYAAEIRDSTRHGARVWLGTFNTAEEAALAYDQAAFATRGASVPLNFPIERVMESLEKINFRCEEGSSPAKALKMMNAYATTRKKPVEEAEDRVVLQDLGSDLLDQLLSQSSTTTQLPSNHQY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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