当前解析结果
SmilChr04G002821| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002821 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002821 |
| 描述 | uncharacterized mitochondrial protein AtMg00810-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 44266637 - 44267112 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023487 |
|---|---|
| GeneID | 131023487 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023487 |
| 原始查询 | SmilChr04G002821 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | orf490; symbol=orf490; hit=gene-orf490; species=rice; confidence=low |
| 产物 | orf490; symbol=orf490; hit=gene-orf490; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | ATMG00810- identity=30.9; qcov=1.34; evalue=9.17e-16; confidence=low |
| Rice | gene-orf490 (orf490)- identity=34.2; qcov=1.37; evalue=4.49e-21; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023487 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057809012.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057809012.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809012.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809012.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057809012.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:44266648 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B10 |
Chr4:44266673 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B33,D11 |
Chr4:44266689 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B107,B130,B63,C53 |
Chr4:44266691 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B64 |
Chr4:44266708 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,B35,B55,C23 |
Chr4:44266710 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 21 | A1,A22,A6,A8,B113,B139,B22,B45,B6,B66,B91,B97,C10,C17,C18,C27,C28,C32,C63,C68,C71 |
Chr4:44266902 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C17 |
Chr4:44266902 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C17 |
Chr4:44266930 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C17 |
Chr4:44266933 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B107,B130,B63,C53 |
Chr4:44266976 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B102,B118,B33,B34,B44 |
Chr4:44266993 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。