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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002828`

染色体: Chr04 坐标: 44372466-44374581 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002828`
名称	SmilChr04G002828
描述	probable methyltransferase At1g29790
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	44372466 - 44374581 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021919`
GeneID	`131021919`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021919`
原始查询	`SmilChr04G002828`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable methyltransferase At1g29790
产物	probable methyltransferase At1g29790
Arabidopsis	`AT3G05390` (AT3G05390) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819703] identity=40.7; qcov=0.947; evalue=4.15e-94; confidence=medium
Rice	`Os08g0113400` - identity=51.9; qcov=0.778; evalue=1.76e-91; confidence=high
GO	GO:0008168 (methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03141 (Methyltransf_29); PF08241 (Methyltransf_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021919

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057807241.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057807241.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807241.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807241.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807241.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:44372744`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B121,D4
`Chr4:44372744`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B121,D4
`Chr4:44372746`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B121,D4
`Chr4:44372746`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B121,D4
`Chr4:44372844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr4:44372859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B113,B46,B68,C9
`Chr4:44372972`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C56
`Chr4:44372972`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C56
`Chr4:44373050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:44373197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B98
`Chr4:44373511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B126,B128,B64,B81,C41,C50,C6
`Chr4:44373675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C28,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807241.1

379 aa

190

379

Methyltransf_29

Methyltransf_11

PF03141 Methyltransf_29 201-321 aa PF08241 Methyltransf_11 227-321 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807241.1`	Pfam	`PF03141`	Methyltransf_29	Family	201	321	2.7e-09	36.9	Putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase
`XP_057807241.1`	Pfam	`PF08241`	Methyltransf_11	Domain	227	321	6.6e-07	30.6	Methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951258.1
ACAAAGCAATATGAAAGAACCTACTTCCCCATAATTGAAGCTGCCAAACATTGACCTCTATTATTTAAACTAACTTTGCCACATGAACTTCAAAGTATTAAATTAACCCATCACTCATCTCTAAACTTTATAACTCTTTTCAGAGATCCAAAACCCATGGAATTCTCTTGCAATACCCTCTTTTTCCTTCTCCTCCTACTCTCATCAAATCTTTTCACTTTGTTCATCTTCACAACTTTCTACTCTTCCTCATGCTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021919
ATGGAATTCTCTTGCAATACCCTCTTTTTCCTTCTCCTCCTACTCTCATCAAATCTTTTCACTTTGTTCATCTTCACAACTTTCTACTCTTCCTCATGCTCTCTCAACCCTCACTTACAGTCCGATCCACCCTCTCCGGAGGACTTGAAAACTGAAACCCTAGACCTCCCCTCCGAGTTCGTCGCCTTCACATCTCCACAGAAGCTCCCATTCGGTTTCAACCGCAATTTCGACTCCGACAAGATCCTGCCGTCGGTGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807241.1
MEFSCNTLFFLLLLLSSNLFTLFIFTTFYSSSCSLNPHLQSDPPSPEDLKTETLDLPSEFVAFTSPQKLPFGFNRNFDSDKILPSVGSSCTLFQGDLRRYMSYEVNGSCPDDELLSQKLLLKGCEPLPRRRCRPAAPGNPVEPRPLPDSLWSTPSDATVVWTAYSCKNYSCLINRWRKQKGFDDCKDCFDLEGRERRRWSGHAASNLDFTIEEVLGAKPPGSIRIGLDIGGGVATFAVRMRERNVTIMTTSMNLNGPFNS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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