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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002831`

染色体: Chr04 坐标: 44425118-44430588 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002831`
名称	SmilChr04G002831
描述	tRNA threonylcarbamoyladenosine dehydratase
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	44425118 - 44430588 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021915`
GeneID	`131021915`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021915`
原始查询	`SmilChr04G002831`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA threonylcarbamoyladenosine dehydratase
产物	tRNA threonylcarbamoyladenosine dehydratase
Arabidopsis	`AT5G37530` (AT5G37530) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833731] identity=74.4; qcov=0.955; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0251000` - identity=76.1; qcov=0.187; evalue=2.1e-21; confidence=weak
GO	GO:0008641 (ubiquitin-like modifier activating enzyme activity); GO:0009536 (plastid); GO:0061503 (tRNA threonylcarbamoyladenosine dehydratase activity); GO:0061504 (cyclic threonylcarbamoyladenosine biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF00899 (ThiF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021915

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057807236.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057807236.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807236.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807236.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807236.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:44426885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:44426897`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C61
`Chr4:44426897`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C61
`Chr4:44427503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr4:44427524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C28
`Chr4:44428171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:44428519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:44428547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:44428554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:44428597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:44429336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr4:44430200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B13,B67,B84,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807236.1

454 aa

227

454

ThiF

PF00899 ThiF 75-334 aa

XP_057807237.1

380 aa

190

380

ThiF

PF00899 ThiF 75-335 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807236.1`	Pfam	`PF00899`	ThiF	Domain	75	334	5.5e-45	154.1	ThiF family
`XP_057807237.1`	Pfam	`PF00899`	ThiF	Domain	75	335	4e-45	154.5	ThiF family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951253.1
AAAAGTCAAGTGGGACGAAGGCAATATATAGATTTTATTTTTTTTATTATTATTAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTTAAAGGTGGCTCTCTGGTTGAAGCGGCAGCACACCTGAATTTGAGTTGTATGGTTTTGAAGTTAAACCCTGAATCTCGCCGCTTGTAGAGACAGAGATGGGAGAGAGAGGGAAATATGTGGTGTTGCTTGGAGCTGGAGCTCTACTAGGTTCTGCTGCTACCCTTGCAATCTTCAAACTTCTCGCC...

XM_057951254.1
AAAAAAGAGTTAAAGGTGGCTCTCTGGTTGAAGCGGCAGCACACCTGAATTTGAGTTGTATGGTTTTGAAGTTAAACCCTGAATCTCGCCGCTTGTAGAGACAGAGATGGGAGAGAGAGGGAAATATGTGGTGTTGCTTGGAGCTGGAGCTCTACTAGGTTCTGCTGCTACCCTTGCAATCTTCAAACTTCTCGCCGGACGGGTTGGAAGGGAATGTGCTAATGTGGACTCCATTGAATCCAAAGAATGTAAGTTCTTGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021915
ATGGGAGAGAGAGGGAAATATGTGGTGTTGCTTGGAGCTGGAGCTCTACTAGGTTCTGCTGCTACCCTTGCAATCTTCAAACTTCTCGCCGGACGGGTTGGAAGGGAATGTGCTAATGTGGACTCCATTGAATCCAAAGAATGTAAGTTCTTGGAGGGTGTGAATCATGGTGTGGTGGGTACTGAACTGCTAATGGATGATATTGTATCTGAACAACTTACAAGGAATACTCAGTTCTTTGGCTTGGAAAACCAGAAAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807236.1
MGERGKYVVLLGAGALLGSAATLAIFKLLAGRVGRECANVDSIESKECKFLEGVNHGVVGTELLMDDIVSEQLTRNTQFFGLENQKKVVTSYVVVIGLGGVGSHAASMLLRSGVGKLLLVDFDQVSVSSLNRHAVATREDVGTPKALCLKKHFSAIFPECHVDAKVMVYDSSSEDEILSGNPDFVLDCIDNIDTKVALLAACVRRGLKVLSATGAGARADPTRIRVADLRESTNDPLSRAVRHRLRKDHGIEGGIPVVFS...

XP_057807237.1
MGERGKYVVLLGAGALLGSAATLAIFKLLAGRVGRECANVDSIESKECKFLEGVNHGVVGTELLMDDIVSEQLTRNTQFFGLENQKKVVTSYVVVIGLGGVGSHAASMLLRSGVGKLLLVDFDQVSVSSLNRHAVATREDVGTPKALCLKKHFSAIFPECHVDAKVMVYDSSSEDEILSGNPDFVLDCIDNIDTKVALLAACVRRGLKVLSATGAGARADPTRIRVADLRESTNDPLSRAVRHRLRKDHGIEGGIPVVFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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