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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002835`

染色体: Chr04 坐标: 44501259-44502909 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002835`
名称	SmilChr04G002835
描述	aspartic proteinase PCS1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	44501259 - 44502909 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021917`
GeneID	`131021917`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021917`
原始查询	`SmilChr04G002835`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartic proteinase PCS1
产物	aspartic proteinase PCS1
Arabidopsis	`AT1G66180` (AT1G66180) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842933] identity=66.4; qcov=0.929; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0271900` (OJ1261C08.11) - identity=35.4; qcov=0.943; evalue=5.79e-68; confidence=medium
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021917

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057807239.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807239.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807239.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807239.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807239.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:44501588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B130,B63,C53
`Chr4:44501666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:44501783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B13,B67
`Chr4:44501879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,D3,D7
`Chr4:44501947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:44502076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr4:44502362`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B117
`Chr4:44502362`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B117
`Chr4:44502560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,D3,D7
`Chr4:44502564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807239.1

420 aa

210

420

TAXi_N

Asp

TAXi_C

PF14543 TAXi_N 66-223 aa PF00026 Asp 69-413 aa PF14541 TAXi_C 256-412 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807239.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	66	223	8e-37	127.8	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057807239.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	69	413	2.3e-12	47.7	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057807239.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	256	412	4.5e-36	124.8	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951256.1
GAATTATAAATGCACATAATATTTCAAGATTAAGATTTTAGATGTGAGCACGCAAGAAATTAGAGATCAATCTATTTTTAGTAGTAGCTTTATAGCAGTCTAGAGGAATAGTGATTTTTCTTTGTATATTAATTTGAGGGAAAGCTAAATGGTGATTATTGGATACAACTAGCCTATAATTAGCAAAGTGAAAAGCGCGTCATTCCCTTTCTTTGGCCGCGCATTGTTGTTTCAAACCCATATAAATAAATCCCGTCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021917
ATGACTTGTTGTTCCTCTCTCCTCTTCTTGGCGCTACTGATGACTTGTTTCCACCTCTCTCTCCAAGAAAACACACTCCATGGCTCTTTCCCTCTCACTTCAGCTCCCCTGTCGTCCTCTCTTGTAGCGAAGAAAGGCGCGGGGGAGGCGTTCGGGTACAACTACAAGTCATCCTTCAAGTACTCAATGGCCCTGATCGTCTCCCTCCCCATCGGCACGCCGCCGCAGCCGCAAAAGATGGTGGTGGACACCGGCAGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807239.1
MTCCSSLLFLALLMTCFHLSLQENTLHGSFPLTSAPLSSSLVAKKGAGEAFGYNYKSSFKYSMALIVSLPIGTPPQPQKMVVDTGSQLSWIQCHRKSPRKQPPAAPFDPSLSSSFSVLPCNHPLCKPRIPDFSLPTSCDQNRLCHYSYFYADGTLAEGNLVREKFTFSASQTTPPLILGCATDSGSGEAEGILGMNLGRLSFISQAKVPKFSYCVPRRDTLGGFYLGHNPNSHAFQYIKLLTFPQSQRTPNFDPIAYTVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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