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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002845`

染色体: Chr04 坐标: 44574370-44577009 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002845`
名称	SmilChr04G002845
描述	organic cation/carnitine transporter 1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	44574370 - 44577009 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021913`
GeneID	`131021913`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021913`
原始查询	`SmilChr04G002845`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	organic cation/carnitine transporter 1
产物	organic cation/carnitine transporter 1
Arabidopsis	`AT1G73220` (OCT1) organic cation/carnitine transporter1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843656] identity=54.4; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0562400` - identity=38; qcov=0.947; evalue=9.27e-102; confidence=medium
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00083 (Sugar_tr); PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021913

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057807234.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057807234.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057807234.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807234.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807234.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:44574987`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A10,B22,C20
`Chr4:44574987`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A10,B22,C20
`Chr4:44575222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,C42,C73
`Chr4:44575717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B122,B20
`Chr4:44575792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B35,B55,C23,C36
`Chr4:44576053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B35,B55,C23,C36
`Chr4:44576668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807234.1

545 aa

272

545

MFS_1

Sugar_tr

PF07690 MFS_1 119-475 aa PF00083 Sugar_tr 119-516 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807234.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	119	475	9.1e-23	81.4	Major Facilitator Superfamily
`XP_057807234.1`	Pfam	`PF00083`	Sugar_tr	Family	119	516	1.1e-32	114.3	Sugar (and other) transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951251.1
AATAAGCTGTTTTTTATCATTCCAAAATTAGTATTGCACGAAAATTTAACCAAGGCTGTTCACGCATGCCGAGGAGAGAATAATTATTGAAATATACTATGTGAGAATATAGAATCAGCATCTTGAAGCATCTCGTACTCAGTGGGAATAACTCTGTTCCCACTAGAACAGCACCAATCATTTCTCTAGCTCAACTATCTCATCCCATACAGTACATATTTTGATAAAATGCATTCAACCTTGAATTTGGGACATAAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021913
ATGGATGAGGAAAAACATCGACTTATGAGAGAGCCAAGTGGAGTAGGGAACAAGCTGCAGCTTACAGTGGATGAGGTGGTGGAGGAATATGTTGGATCGTTTGGATTCTCACAGCTTGTGCAGGTAACCTTGGTCTCCCTGGCTCGGATATTTGATGCCCACTGCACCCTTGTCACCATCTTCACAGATGCTCAGCCACAGTCGTGGCGGTGCATTGGCCACGAATGCGGTAGCACTGGTGGCAGCACCGCTGCTTCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807234.1
MDEEKHRLMREPSGVGNKLQLTVDEVVEEYVGSFGFSQLVQVTLVSLARIFDAHCTLVTIFTDAQPQSWRCIGHECGSTGGSTAASVCGLEPGTWEWSGGNTSSTIAEWGLVCDRRFLAALPTSVYFLGSLIGSAVFGRLADGRLGRKRAVLASCLLTAATIFLTSFSPNIWIYSLLRFANGFSRAGMGICCLVLSTETIGRRWRGQVGQVGFFFFAAGFLSIPVIAYPTRTCWRTLYRIISILPLLYSIFILMPFVAES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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