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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002849`

染色体: Chr04 坐标: 44595315-44595755 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002849`
名称	SmilChr04G002849
描述	uncharacterized SmilChr04G002849
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	44595315 - 44595755 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023492`
GeneID	`131023492`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023492`
原始查询	`SmilChr04G002849`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0643433` - identity=32.7; qcov=0.733; evalue=3.45e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023492

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809018.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057809018.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809018.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809018.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809018.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:44595323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B126,B90,B92,D3
`Chr4:44595323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B90,B92,D3
`Chr4:44595342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr4:44595359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B66,C1,C4
`Chr4:44595370`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	59	A11,A16,A20,A21,A22,A4,A5,B1,B111,B114,B119,B12,B120,B121,B139,B140,B18,B21,B36,B37,B4,B40,B46,B48,B5,B52,B54,B57,B63,B7,B74,B83,B86,B90,B92,B98,B99,C1,C10,C13,C20,C24,C26,C29,C3,C37,C4,C47,C52,C54,C61,C67,C71,C74,C75,C78,D10,D4,D5
`Chr4:44595375`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	57	A11,A16,A20,A21,A22,A4,A5,B1,B111,B114,B119,B12,B121,B136,B139,B140,B18,B21,B36,B37,B4,B46,B48,B5,B52,B54,B57,B63,B7,B74,B83,B86,B90,B92,B98,B99,C10,C13,C20,C24,C26,C29,C3,C37,C4,C47,C52,C54,C61,C67,C71,C74,C75,C78,D10,D4,D5
`Chr4:44595404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr4:44595465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr4:44595472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B118,B33,B34,B44
`Chr4:44595474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr4:44595508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A19,B109,B112,B119,B121,B131,B40,B54,C34,C43,C79
`Chr4:44595526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B54,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809018.1

146 aa

146

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 57-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809018.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	57	146	4.2e-18	66.5	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953035.1
ATGGGTTTCTTCTGTGGTGAGTCTTGGTCTTGGGTTTTTAGATGGGGAAGGATTTTTAATGCTAACGATTTGCTTGAGTTCTTGGAGCTATGGAACTGTGTTTGGAGGTGTAAAATTTTGGCTCACAAGACAGATTCCATCAGCTGGGTTGATTCATCGGATGAGCTTTTTTCAACTCGTTCTATGTATGGTGCCTTGTCCAATGATGATTCAGGAGCTACTAATGTCTCTTCCCTTTCAAAGGTGTGGTGGAAAACAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023492
ATGGGTTTCTTCTGTGGTGAGTCTTGGTCTTGGGTTTTTAGATGGGGAAGGATTTTTAATGCTAACGATTTGCTTGAGTTCTTGGAGCTATGGAACTGTGTTTGGAGGTGTAAAATTTTGGCTCACAAGACAGATTCCATCAGCTGGGTTGATTCATCGGATGAGCTTTTTTCAACTCGTTCTATGTATGGTGCCTTGTCCAATGATGATTCAGGAGCTACTAATGTCTCTTCCCTTTCAAAGGTGTGGTGGAAAACAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809018.1
MGFFCGESWSWVFRWGRIFNANDLLEFLELWNCVWRCKILAHKTDSISWVDSSDELFSTRSMYGALSNDDSGATNVSSLSKVWWKTIPVKVSAFCWKLLQDRIHTKENLSKRNILSADQSLACAFCSESPESASHLMIECQFTAQV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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