当前解析结果
SmilChr04G002856| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002856 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002856 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002856 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 44671026 - 44672169 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131021941 |
|---|---|
| GeneID | 131021941 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021941 |
| 原始查询 | SmilChr04G002856 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021941 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057807268.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057807268.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057807268.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057807268.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057807268.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:44671651 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | A18,B9,C54 |
Chr4:44671651 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A18,B9,C54 |
Chr4:44671705 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B95,B98,C36 |
Chr4:44671719 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 28 | A15,A25,B100,B114,B118,B130,B131,B134,B14,B38,B39,B4,B43,B55,B57,B60,B63,B91,B95,C13,C2,C22,C25,C4,C41,C48,C63,C74 |
Chr4:44671724 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 4 | B133,B134,B47,B84 |
Chr4:44671724 |
A |
AG |
1bp_insertion | CDS_variant | 4 | B133,B134,B47,B84 |
Chr4:44671726 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | B23,B39,B47,B57,B90,C41,C85 |
Chr4:44671748 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B134,B75,B94,C1,C25 |
Chr4:44671761 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B96 |
Chr4:44671769 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B120,B18,C24 |
Chr4:44671771 |
A |
AAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 9 | A10,B111,B137,B37,B8,C15,C3,C33,C5 |
Chr4:44671778 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B21 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。