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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr04G002861

染色体: Chr04 坐标: 44705530-44706336 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr04G002861
名称SmilChr04G002861
描述uncharacterized SmilChr04G002861
染色体 / SeqIDChr04 / NC_080390.1
坐标与链方向44705530 - 44706336 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131021939
GeneID131021939
locus_tag-
NCBI NameLOC131021939
原始查询SmilChr04G002861

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述B-cell receptor-associated-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831583]; symbol=AT5G17190; hit=AT5G17190; species=arabidopsis; confidence=high
产物B-cell receptor-associated-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831583]; symbol=AT5G17190; hit=AT5G17190; species=arabidopsis; confidence=high
ArabidopsisAT5G17190 (AT5G17190)
B-cell receptor-associated-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831583]
identity=77.7; qcov=1; evalue=7.17e-79; confidence=high
RiceOs02g0734900
-
identity=74.8; qcov=1.01; evalue=1.55e-58; confidence=high
GOGO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0070973 (protein localization to endoplasmic reticulum exit site)
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131021939

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Endoplasmic reticulum membrane 内质网膜 1.00000 XP_057807264.1
2 Vesicle 囊泡 1.00000 XP_057807264.1
3 Endoplasmic reticulum 内质网 0.80000 XP_057807264.1
4 Cytoplasmic vesicle 细胞质囊泡 0.40000 XP_057807264.1
5 Endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment Endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment 0.40000 XP_057807264.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr4:44705848 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B84,C57
Chr4:44705977 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B82
Chr4:44706046 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B104

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预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057951281.1
GTTTGGAAGGTAAGAACAATGAAACTGCTGGTGTAAAAAGGCCATGATATTTTAGCCCATATGTGAGGCCCATTCAAAGGTACCTTCCTTAACCCACTCACCCACCGCTCTCTCTCACCACCCCCCATAAATTTCTCCCCTGCCTGCTTTGTCTTTCTAGGAAATCCCCTTTCATCTCACAATCTCTCTCAGATCACCATCGATGGCGTTGGAATGGGTAGTTCTCGGTTACGCCGCTGGCGCAGAAGCCATCATGCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131021939
ATGGCGTTGGAATGGGTAGTTCTCGGTTACGCCGCTGGCGCAGAAGCCATCATGCTCCTCTTCCTCACCCTCCCGGGCCTTGACCCGATACGAAAGGGCCTAATCACCGTGACCCGCAGTCTCCTCAAACCCTTCCTCTCCGTCGTTCCCTTCTGCCTCTTCCTGCTAATGGATATCTACTGGAAGTACGAGAACCGACCCACCTGTGAGTCAGATTCGTGCTCCCCAACGGAGCACCTCCGCCACCAGAAATCGATCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057807264.1
MALEWVVLGYAAGAEAIMLLFLTLPGLDPIRKGLITVTRSLLKPFLSVVPFCLFLLMDIYWKYENRPTCESDSCSPTEHLRHQKSIMKSQRNALLIASALIFYWLLYSVTGLVVKMDQLNKRIEKLKAQD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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