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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002863`

染色体: Chr04 坐标: 44719588-44721933 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002863`
名称	SmilChr04G002863
描述	probable inactive receptor kinase At1g48480
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	44719588 - 44721933 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021910`
GeneID	`131021910`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021910`
原始查询	`SmilChr04G002863`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable inactive receptor kinase At1g48480
产物	probable inactive receptor kinase At1g48480
Arabidopsis	`AT1G48480` (RKL1) receptor-like kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841269] identity=53.7; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0463000` - identity=46.8; qcov=1.06; evalue=3.38e-178; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021910

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057807231.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807231.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807231.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807231.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807231.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:44720016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:44720058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr4:44720109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr4:44720111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr4:44720168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr4:44720253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr4:44720271`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B121
`Chr4:44720271`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B121
`Chr4:44720419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr4:44720595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:44721027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr4:44721162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807231.1

587 aa

294

587

LRRNT_2

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF08263 LRRNT_2 24-60 aa PF00560 LRR_1 90-108 aa PF00560 LRR_1 139-161 aa PF00560 LRR_1 186-205 aa PF00069 Pkinase 315-570 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 315-571 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807231.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	24	60	1.9e-09	38.4	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057807231.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	90	108	3.8e-10	38.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057807231.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	139	161	3.8e-10	38.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057807231.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	186	205	3.8e-10	38.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057807231.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	315	570	5.6e-35	121.7	Protein kinase domain
`XP_057807231.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	315	571	1.6e-35	123.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951248.1
CCCAATAATCAATATGGGGGATCATCGTATTTTACTGTTTCCAATTGGGTTTTAATACTAACAACGCAAAATCCCAGCTCACAAATCTCTCATTCTCTCTCTTTCCGTTACATTTGTATCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAATCTGACAAAAACCAGAGTGTAAGTTTTCATACATGAAGAAGAGCGCAGACAACATGAATCTCCCTTGACTTACTTCCTCAAAATCCCCGAAAAATCTGACAAAAAAATTCGGGGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021910
ATGGGCGTTTTGAATTTCCACCACCTTTTCCTGGTGGTGGTCCTCCTCCCCTTGGCGACGCCGGACATCGCTTCCGATAGAGCCGCTCTACTAGCCCTCCGCAGCGCCGTGGGCGGCCGCGTCCTCTTGTGGAACCTCTCGAGCGCCAGCCCCTGCTCGTGGGCCGGCGTCATCTGCTCGCCAGATAACTCCTCCGTTGTGGAGCTCCGCCTCCCCGGAATGGGGCTCTCCGGCCAGCTGCCGCCCAACACCATCTCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807231.1
MGVLNFHHLFLVVVLLPLATPDIASDRAALLALRSAVGGRVLLWNLSSASPCSWAGVICSPDNSSVVELRLPGMGLSGQLPPNTISNLTNLQTLSLRFNSLSGPLPANMFSSLNSLRNIYMQNNLFIGGVPDSLFSVKSLVRLNLAHNNFSGPISASFNKLTRLGTLYLQNNHFSGSLPDLNLPALIQFDVSNNNLTGPIPSGLAGKPKSSFAGNSLCGPPLDSCAVDKPKKKLSAGAIAGIVIGSVIGFFLILLLILYL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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