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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002868`

染色体: Chr04 坐标: 44802139-44803731 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002868`
名称	SmilChr04G002868
描述	uncharacterized SmilChr04G002868
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	44802139 - 44803731 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023495`
GeneID	`131023495`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023495`
原始查询	`SmilChr04G002868`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=33; qcov=0.343; evalue=5.2e-22; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=22.3; qcov=0.457; evalue=3.51e-09; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023495

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809021.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057809021.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.60000	`XP_057809021.1`
4	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057809021.1`
5	P-body	P-body	0.40000	`XP_057809021.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:44802151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:44802170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B24,C67
`Chr4:44802179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr4:44802192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B26,B69,C5,C80
`Chr4:44802202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A22,B112,B136,B21,B44,B91
`Chr4:44802219`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C37
`Chr4:44802219`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C37
`Chr4:44802221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr4:44802228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C70,C84
`Chr4:44802233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B126,B54,C15,C58
`Chr4:44802246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,C42,C73
`Chr4:44802260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C67,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809021.1

530 aa

265

530

DUF4283

PF14111 DUF4283 20-105 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809021.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	20	105	1e-06	29.0	Domain of unknown function (DUF4283)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953038.1
ATGGACGACAGGCTGTGCCTTTCTATTTTCTCGGCTTTCCGTCAACGGCAAATCAAATCCTTTCAGCATGCTATTCATGGGAGGGTTTTCCTTCGCAAAGGCGATTCGCCGAGATTTGCGGCGGATCTTTTTACTGAGCTCTCTATCCTTTGGAAAACGTCGTCTCCTTGGCAGGTTATCCCTCTGGGCAAGGGATATTTCACTTTGAAGTTCTTGTCACCTGAGGATTATGCTTTGGCTTTCGCAAAATCTGCTTGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023495
ATGGACGACAGGCTGTGCCTTTCTATTTTCTCGGCTTTCCGTCAACGGCAAATCAAATCCTTTCAGCATGCTATTCATGGGAGGGTTTTCCTTCGCAAAGGCGATTCGCCGAGATTTGCGGCGGATCTTTTTACTGAGCTCTCTATCCTTTGGAAAACGTCGTCTCCTTGGCAGGTTATCCCTCTGGGCAAGGGATATTTCACTTTGAAGTTCTTGTCACCTGAGGATTATGCTTTGGCTTTCGCAAAATCTGCTTGGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809021.1
MDDRLCLSIFSAFRQRQIKSFQHAIHGRVFLRKGDSPRFAADLFTELSILWKTSSPWQVIPLGKGYFTLKFLSPEDYALAFAKSAWRLRVGILFLQAWTPNFNPNKIVSSTAQVWVRIFNLPHKFWHPEVLSGIARHVGTPILVDGMSARASVGYFARVLVEMNVALDIPQFLDVKCDDDIYEIEFGYENLPYFCCLCSAIGHATDDCKLSSGKELASPTKQTEQDNSLRGRKHRSRSRKWKKTRNRSVTNRQRANEGPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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