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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002880`

染色体: Chr04 坐标: 45007196-45007957 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002880`
名称	SmilChr04G002880
描述	fructokinase-like 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45007196 - 45007957 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023497`
GeneID	`131023497`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023497`
原始查询	`SmilChr04G002880`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fructokinase-like 1, chloroplastic
产物	fructokinase-like 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G54090` (FLN1) fructokinase-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824576] identity=54.7; qcov=0.838; evalue=4.37e-67; confidence=high
Rice	`Os01g0851000` (WLP2) - identity=60.6; qcov=0.542; evalue=2.68e-46; confidence=medium
GO	GO:0009658 (chloroplast organization); GO:0016301 (kinase activity); GO:0042644 (chloroplast nucleoid); GO:0042793 (plastid transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00294 (PfkB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023497

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809023.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057809023.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809023.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809023.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809023.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45007249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B44
`Chr4:45007272`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	56	A13,A14,A19,A4,A7,B102,B105,B106,B109,B11,B113,B118,B123,B124,B129,B138,B18,B19,B38,B39,B47,B48,B50,B61,B62,B7,B70,B72,B8,B86,B9,B94,C20,C22,C33,C38,C39,C4,C40,C47,C54,C58,C60,C67,C7,C70,C75,C76,C78,C79,C80,C82,C83,D1,D3,D9
`Chr4:45007277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B44
`Chr4:45007280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:45007298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr4:45007314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr4:45007326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B57,B88,C77
`Chr4:45007344`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A8,B21,B44,B45,B50,B66,C27,C28,C55,C63
`Chr4:45007419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B63
`Chr4:45007451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr4:45007456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr4:45007468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,C31,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809023.1

253 aa

126

253

PfkB

PF00294 PfkB 134-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809023.1`	Pfam	`PF00294`	PfkB	Domain	134	200	9.1e-12	45.6	pfkB family carbohydrate kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953040.1
ATGGCAACTCTTGAGCTCCTACTCCACCATTCTCATTCATTTGCCCTAAGTCAGCACCCCATCATCAATTTCTCAAGTTTTCGCCCAATTTACCCCAAATTACCGCCTATCAAATCCTCCGCCACTGATTCTCCATCCACCAGCTCCACCACCCCCCGCCGCGGCCGCAAAAAGTCCACCACCACCTCCACAACGAAAAGATCAAGGCTACTGAGGAAATCAGGAGATTCGCCAGACACCAAAAATGTCGACGACGAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023497
ATGGCAACTCTTGAGCTCCTACTCCACCATTCTCATTCATTTGCCCTAAGTCAGCACCCCATCATCAATTTCTCAAGTTTTCGCCCAATTTACCCCAAATTACCGCCTATCAAATCCTCCGCCACTGATTCTCCATCCACCAGCTCCACCACCCCCCGCCGCGGCCGCAAAAAGTCCACCACCACCTCCACAACGAAAAGATCAAGGCTACTGAGGAAATCAGGAGATTCGCCAGACACCAAAAATGTCGACGACGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809023.1
MATLELLLHHSHSFALSQHPIINFSSFRPIYPKLPPIKSSATDSPSTSSTTPRRGRKKSTTTSTTKRSRLLRKSGDSPDTKNVDDELYDYDDGVDFPYLDPPLVCCFGDAQKEFVPTVRVAPEQMHPYIYSQWKMLQWNPPEFARAPGGPPSNVAISHVRLGGRAAFMGKVGNDEFGEELVLMMNKERVQTRGVKFDDKAAVGMSCCCCWDCRTGEREGGAGGRGSGAGAGGRRGWEAEGNRGGGPRGWNELN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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