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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002900`

染色体: Chr04 坐标: 45273378-45273800 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002900`
名称	SmilChr04G002900
描述	uncharacterized SmilChr04G002900
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45273378 - 45273800 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023501`
GeneID	`131023501`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023501`
原始查询	`SmilChr04G002900`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=44.4; qcov=0.707; evalue=8.02e-20; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=50.7; qcov=1.06; evalue=7.86e-43; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023501

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057809026.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057809026.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057809026.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809026.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809026.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45273426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B86
`Chr4:45273438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A21,B104,B126,B20,C71
`Chr4:45273438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B104,B126,B20,C71
`Chr4:45273442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:45273443`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A3,B107,B63,B69,B76,B84,B86,C23,C25,C31,C32,C5,C86
`Chr4:45273452`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B103,B117,B2,C18,C46
`Chr4:45273452`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B103,B117,B2,C18,C46
`Chr4:45273480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	28	A22,B103,B104,B107,B110,B112,B115,B117,B136,B2,B21,B43,B44,B56,B61,B72,B74,B91,C14,C18,C21,C38,C49,C55,C67,C71,C77,D1
`Chr4:45273494`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	B104,B110,B42,B43,B61,B66,B72,B74,C21,C38,D1
`Chr4:45273502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B90,B92,C31,C81
`Chr4:45273531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	B103,B117,B128,B26,B36,B42,B43,B46,B49,B56,B60,B61,B66,B72,B74,C18,C21,C38,C49,D1
`Chr4:45273540`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A7,A9,B1,B111,B12,B120,B125,B134,B140,B25,B33,B4,B55,B60,B77,B90,B92,B93,B98,C5,C56,C72,C87,D2,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809026.1

140 aa

140

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 82-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809026.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	82	140	1.4e-11	45.1	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953043.1
ATGCGTCGTCCCTTATTTTTGCGCATCGTCAATGTCGTGCAGTCTGATCCTTACTTCCAACAATGTTCAAACGCATTTGGTAGACGCGGCTTTACACCGCTGCAGAAATGCACAATTACTATTCGGCAACTTGCAAATGGAGGTGCAACTGATCAATACGATGAGTACATGCGGATTGCAGAGTCCATATTGTTGGAGTGCTTGAGAAAATTCTGTCGAATCATCGTCCAACTCTTTGGCGCCGAATACTTGAGGAGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023501
ATGCGTCGTCCCTTATTTTTGCGCATCGTCAATGTCGTGCAGTCTGATCCTTACTTCCAACAATGTTCAAACGCATTTGGTAGACGCGGCTTTACACCGCTGCAGAAATGCACAATTACTATTCGGCAACTTGCAAATGGAGGTGCAACTGATCAATACGATGAGTACATGCGGATTGCAGAGTCCATATTGTTGGAGTGCTTGAGAAAATTCTGTCGAATCATCGTCCAACTCTTTGGCGCCGAATACTTGAGGAGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809026.1
MRRPLFLRIVNVVQSDPYFQQCSNAFGRRGFTPLQKCTITIRQLANGGATDQYDEYMRIAESILLECLRKFCRIIVQLFGAEYLRRPTYTDYQRLLALHEKKHEFPGMLRSLDFMYWAWQGAYTRGDQGEPTNILKAVAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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