当前解析结果
SmilChr04G002904| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002904 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002904 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002904 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 45306562 - 45311443 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131021987 |
|---|---|
| GeneID | 131021987 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021987 |
| 原始查询 | SmilChr04G002904 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842902]; symbol=AT1G65900; hit=AT1G65900; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842902]; symbol=AT1G65900; hit=AT1G65900; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT1G65900 (AT1G65900)plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842902] identity=65.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os03g0120000- identity=68.2; qcov=0.212; evalue=1.5e-35; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021987 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057807303.1 |
| 2 | Cell wall | 细胞壁 | 0.40000 | XP_057807303.1 |
| 3 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057807303.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057807303.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057807303.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:45309847 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 11 | A16,B1,B126,B127,B133,B27,B42,B43,B51,C70,D5 |
Chr4:45309927 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr4:45310217 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B17 |
Chr4:45310217 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B17 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。