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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002906`

染色体: Chr04 坐标: 45324993-45326126 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002906`
名称	SmilChr04G002906
描述	probable beta-1,3-galactosyltransferase 12
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45324993 - 45326126 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022807`
GeneID	`131022807`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022807`
原始查询	`SmilChr04G002906`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable beta-1,3-galactosyltransferase 12
产物	probable beta-1%2C3-galactosyltransferase 12
Arabidopsis	`AT5G57500` (AT5G57500) Galactosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835854] identity=58; qcov=0.923; evalue=1.08e-108; confidence=high
Rice	`Os02g0785000` - identity=53.8; qcov=0.891; evalue=5.93e-95; confidence=high
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016758 (hexosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01762 (Galactosyl_T)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022807

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057808313.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057808313.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808313.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808313.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808313.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45325278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B84,C57,C62,D2
`Chr4:45325348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B70,C80
`Chr4:45325378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr4:45325407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B35,B55,C23
`Chr4:45325440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:45325445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr4:45325454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B46
`Chr4:45325471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B31,B8,C51,C57
`Chr4:45325502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr4:45325505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B28,B3,B67,C50
`Chr4:45325535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:45325545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808313.1

284 aa

142

284

Galactosyl_T

PF01762 Galactosyl_T 57-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808313.1`	Pfam	`PF01762`	Galactosyl_T	Family	57	166	3.3e-12	47.3	Galactosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952330.1
AGATAGTTGTTATGAGAGAGAGGGAGTAGTACAAATTGACAATATGGTGTTTAATTTTTATTTTAGTTTTGTTGCGAGGAATTAGGAAAAATAAAAATAGAGACTCCCGGTACGTAACTCACATTTTCAATCACGGAGTGATCCATTACTTTTCATGTGCAAGTCACAAAGAGATGCCATCTTGTTTACTTTGGTCACATTTTTTTAACATGCCTTAGTGCTAAATGGCAATCGGCCTTTAATTTGGATGTGCTGTCTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022807
ATGCTACGGCTAAGACTAATCCAAGACATACTATCCATATCCGCCATCATCATCTTCACCTTCTTCATCTTCTGCAGCATCAAATACACCACCACCAAAATCCAAGCCTCGCCACGGCCGCCTCCCTTGAGCCTCCTCATCGGCATCCTCACCCTCCCCGATAAATACGAGCGCCGCCACTTCCTCCGCCTCATCTACGGCACACAGCAAAACTCCCCCGCAACAATCGACGTCAAGTTCGTCCTCTGCAACCTCACCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808313.1
MLRLRLIQDILSISAIIIFTFFIFCSIKYTTTKIQASPRPPPLSLLIGILTLPDKYERRHFLRLIYGTQQNSPATIDVKFVLCNLTKAEQRAFIALEIMRFDDIIILNCSENMNSGKTYTYFSSLPRILPAKYDYVMKADDDVYLRLEPLALSLEALPRSDLYYGFVIPCPSMNPLVHYMSGMAFVLSWDLVEWISTSVIAANHTFGPEDKMVGEWLNRGDKAKNRVSNKPAMYDYPGTNGRCSHELIPDTVAVHRVKRW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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