当前解析结果
SmilChr04G002909| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002909 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002909 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002909 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 45339572 - 45340322 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023503 |
|---|---|
| GeneID | 131023503 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023503 |
| 原始查询 | SmilChr04G002909 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023503 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057809029.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057809029.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809029.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809029.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057809029.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:45339624 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B124,C20 |
Chr4:45339678 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,B45,D6 |
Chr4:45339683 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,B45,D6 |
Chr4:45339698 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B100,B43,B45,C86,D6 |
Chr4:45339702 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B100,B43,B45,D6 |
Chr4:45339730 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B100,B43,B45,C2,D6 |
Chr4:45339806 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B69,C83 |
Chr4:45339806 |
CT |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B69,C83 |
Chr4:45339808 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B43,B45,C2 |
Chr4:45339808 |
T |
TG |
1bp_insertion | CDS_variant | 3 | B43,B45,C2 |
Chr4:45339845 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B45,B99 |
Chr4:45339857 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A23,B69,C57,C83 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。