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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002924`

染色体: Chr04 坐标: 45506385-45508270 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002924`
名称	SmilChr04G002924
描述	uncharacterized SmilChr04G002924
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45506385 - 45508270 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023504`
GeneID	`131023504`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023504`
原始查询	`SmilChr04G002924`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os05g0256350; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os05g0256350; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G17450` (AT3G17450) hAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821009] identity=31.7; qcov=1; evalue=5.26e-55; confidence=low
Rice	`Os05g0256350` - identity=36.8; qcov=0.992; evalue=9.06e-64; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04937 (DUF659); PF26664 (zf-BED_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023504

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809030.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809030.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809030.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809030.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809030.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45506400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B14,B5,B69
`Chr4:45506471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C72
`Chr4:45506670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr4:45506692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B41
`Chr4:45506726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B3,B47,C4
`Chr4:45506742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B3
`Chr4:45506751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B3
`Chr4:45506831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	32	A2,A25,A3,A5,B1,B101,B102,B106,B112,B113,B13,B136,B23,B30,B32,B45,B50,B65,B7,B83,B91,C24,C35,C40,C54,C57,C62,C66,C77,C78,D10,D4
`Chr4:45506840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B95,C24
`Chr4:45506857`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B41
`Chr4:45506857`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B41
`Chr4:45506866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A16,B104,B124,B135,B27,B3,B57,B71,B88,C49,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809030.1

364 aa

182

364

zf-BED_2

DUF659

PF26664 zf-BED_2 29-75 aa PF04937 DUF659 211-360 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809030.1`	Pfam	`PF26664`	zf-BED_2	Domain	29	75	1.4e-09	38.2	BED-like zinc finger
`XP_057809030.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	211	360	2.6e-58	196.6	Domain of unknown function (DUF659)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953047.1
TTAAAAAAGCGCGCCTAGGCGCGGGCTTTAGTCTGGGCGCACGGGTTGGGCTTTTTCCAGAGCCAGGCGCACCAACCTACGAGAGGCACGGCCAAGGCGCATGTAGGCGCCGAAAGCGCGCTTAGGCGCAAAAGCCCACAAGCCCGCGCCTCTTGTGCATTTAGGGTTAGGAGTATTTATTTCAATTTTAGGTTTAGAGTTATTACAAAACACGCATCTCCCTTTCTCCACTCCACTCCTCTGCGCCGCTAGACCCCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023504
ATGGCTTCGGATAAGTCACGTGTATCATCAACGGAGGATGATCATGATGATCCTACTAAAAAATATGGGACGCCCAATCCTTCGAATAAAATTGCATGGACGTGTCATTTTTGTGGGAAAGTCACAAATGGAGGATCCTATCGAATGAAGCAACATTTGGTGGGAGGTTTTAGGAATACAAAGAAATGTCTTAAGGCTCCCGAGCATGTAAGGACGGAAGTGAATGCTTATATGATTAAGAAAGCAACTAGTAAAGTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809030.1
MASDKSRVSSTEDDHDDPTKKYGTPNPSNKIAWTCHFCGKVTNGGSYRMKQHLVGGFRNTKKCLKAPEHVRTEVNAYMIKKATSKVLNQFARNPSHDVGDYDEEEEEVEIEGSSSRTIMSKVAPASKRMKGPLDVLFASKQPSSQSQEVLKGRKERKGIFGASDKVCRDKACEAIARFFYDNAIPFHPATSDSFKGMVEAIGQYGPGLVPPSMYELRVPFLQKEVEATNTKVMEFKKEWAIKGCSILSDGWRDSVVQKDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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