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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002925`

染色体: Chr04 坐标: 45518617-45519699 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002925`
名称	SmilChr04G002925
描述	protein OXIDATIVE STRESS 3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45518617 - 45519699 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023739`
GeneID	`131023739`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023739`
原始查询	`SmilChr04G002925`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein OXIDATIVE STRESS 3-like
产物	protein OXIDATIVE STRESS 3-like
Arabidopsis	`AT5G56550` (OXS3) oxidative stress 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835756] identity=70.5; qcov=0.331; evalue=5.33e-14; confidence=low
Rice	`Os02g0227100` - identity=50; qcov=0.571; evalue=2.08e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30470 (OXS3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023739

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809285.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057809285.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809285.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809285.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809285.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45518852`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	C11,C37,C69
`Chr4:45518852`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	C11,C37,C69
`Chr4:45518894`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	135	A1,A11,A13,A14,A18,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A8,B1,B100,B101,B103,B106,B107,B110,B114,B117,B119,B120,B123,B125,B126,B127,B128,B129,B130,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B139,B14,B15,B19,B2,B21,B23,B24,B26,B27,B29,B37,B38,B39,B41,B42,B43,B51,B56,B57,B58,B61,B63,B64,B65,B66,B70,B72,B73,B76,B77,B80,B81,B83,B84,B85,B87,B88,B89,B91,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C12,C13,C16,C17,C18,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C27,C29,C3,C30,C32,C33,C35,C36,C4,C41,C42,C44,C47,C49,C5,C50,C55,C57,C58,C59,C6,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C70,C73,C84,C85,C87,C9,D10,D2,D5,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809285.1

133 aa

133

OXS3

PF30470 OXS3 29-110 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809285.1`	Pfam	`PF30470`	OXS3	Family	29	110	6.3e-21	75.7	Oxidative stress 3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953302.1
CACTAATTGGGAAAATAAAAAATTGAAGAAAACATACAGAAAAAAAAAAGAAGCTAGTCCTGACCTTATCGTTTTCCCCCTACCCCTGTTGTCCATGTGTCTATATCCATCAATCCCAAATTTCCCAAGAAAAGTTGGATAAAAATCCACTGCATTTATATCATATTGAATTAACTTACAAAATTAATTACTAGAATTATCTGCTCCGAAAAAGTATATATGTATACAATACATTACTCCATGTTTTATATAGTTAAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023739
ATGGAGATGGAGTCCCTTTCGATCGGCCCTCAAATAATGATGAATGAAGATCATCTTCTACTGCGGCGGCGCCGCCCTTTCCGCGGCGGCGATGTTTCCGCTTCTTGCAGCAGTTCAACTTGTACAAATGAAGAAGAAGATGAGCAAGTGAAGTCTTCTACTTCTCCTACCCCCTTGCAAGATATGTCTTCTCTACTCTTACAACTCCCACTTAAGAGAGGGCTATCGAAGCATTACAATGGGAAGTCGCAGTCATTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809285.1
MEMESLSIGPQIMMNEDHLLLRRRRPFRGGDVSASCSSSTCTNEEEDEQVKSSTSPTPLQDMSSLLLQLPLKRGLSKHYNGKSQSFTSLSDVKSLEDLAKQENPFNKKLKICDTTIRGKSNQLWDQNSNFLGK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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