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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002926`

染色体: Chr04 坐标: 45536303-45540661 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002926`
名称	SmilChr04G002926
描述	protein DJ-1 homolog D
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45536303 - 45540661 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023740`
GeneID	`131023740`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023740`
原始查询	`SmilChr04G002926`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DJ-1 homolog D
产物	protein DJ-1 homolog D
Arabidopsis	`AT3G02720` (DJ1D) Class I glutamine amidotransferase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820875] identity=76.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0671700` (OsDJ-1C) - identity=78.4; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	smil00620 (Pyruvate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01965 (DJ-1_PfpI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023740

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809286.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057809286.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809286.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809286.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809286.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45537412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,D10,D11
`Chr4:45537723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B20,C10
`Chr4:45538588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,C80,D10,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809286.1

388 aa

194

388

DJ-1_PfpI

PF01965 DJ-1_PfpI 5-186 aa PF01965 DJ-1_PfpI 198-380 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809286.1`	Pfam	`PF01965`	DJ-1_PfpI	Domain	5	186	2.1e-97	324.3	DJ-1/PfpI family
`XP_057809286.1`	Pfam	`PF01965`	DJ-1_PfpI	Domain	198	380	2.1e-97	324.3	DJ-1/PfpI family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953303.1
GGAATTTAAAACTTTGTGAATTCTCAAATCTGTCCGTCCGCTATGAAATACTAAAAAATAAAAAGTCTTTCCCTTCACAAAATTTTCAAATAAAATAGAAAAAGGTGATATCTTGAAGATGATTGACAAGAATAAATAAACATCACGAACTCTCAAACCCGTCTTTCCACCAAATAAAATAGTAGTAGTACCAAAAATTCATATCTTCAAGATCATTCTACATCATCTACTTCTAAGCTGAGCAGAGAGGTCTAAACCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023740
ATGGCGGGGCAGAAAAGAGTCCTCTTGCTGTGCGGAGACTATGTCGAAGATTACGAGGTGATGGTTCCATTTCAAGCGTTACTGGCATATGGGCTATCCGTTGACGCTGTCTGCCCCGGCAAGAAAGCGGGCGACATTTGTCGCACTGCAATCCATGATCTTCGAGGACATCAGACATATTCCGAGTCAAGGGGGCATAATTTTGCTCTTAATGCTACTTTTAATGAAATAGATACTACCAAATATGATGGATTGGTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809286.1
MAGQKRVLLLCGDYVEDYEVMVPFQALLAYGLSVDAVCPGKKAGDICRTAIHDLRGHQTYSESRGHNFALNATFNEIDTTKYDGLVIPGGRAPEYLAVDESVVALVKKFEDLKKPIASICHGQLILAAADMVKGRKCTAYPALKPALVAAGAHWVEPDTMAFCTSDGNLITGATYDGHPEFIRLFINALGAKISGSGKRILFLCGDFMEDYEVMVPFQSLQALDCHVDAVCPGKKAGETCPTAVHDFEGDQTYSEKPGHN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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