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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002927`

染色体: Chr04 坐标: 45541449-45544972 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002927`
名称	SmilChr04G002927
描述	uncharacterized SmilChr04G002927
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45541449 - 45544972 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021989`
GeneID	`131021989`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021989`
原始查询	`SmilChr04G002927`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821269]; symbol=AT3G02710; hit=AT3G02710; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821269]; symbol=AT3G02710; hit=AT3G02710; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G02710` (AT3G02710) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821269] identity=69.8; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0831300` - identity=60.9; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005681 (spliceosomal complex)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF08216 (CTNNBL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021989

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807304.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057807304.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057807305.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807304.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807304.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45541656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:45541761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr4:45541877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C54,C57
`Chr4:45541879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B73,C51,C55,C56
`Chr4:45541929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr4:45541933`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A18,A21,A4,A8,B126,B127,B130,B131,B134,B2,B27,B31,B36,B37,B41,B42,B66,B76,C15,C16,C17,C21,C31,C37,C43,C45,C50,C58,C71,C74,C76,C85,C86
`Chr4:45541972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,C6,C7
`Chr4:45542006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B22,B27,D4,D6
`Chr4:45542056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr4:45542102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C17
`Chr4:45542117`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B12
`Chr4:45542117`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807304.1

521 aa

260

521

CTNNBL

PF08216 CTNNBL 25-491 aa

XP_057807305.1

477 aa

238

477

CTNNBL

PF08216 CTNNBL 25-191 aa PF08216 CTNNBL 188-447 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807304.1`	Pfam	`PF08216`	CTNNBL	Repeat	25	491	2.3e-170	567.8	Catenin-beta-like, Arm-motif containing nuclear
`XP_057807305.1`	Pfam	`PF08216`	CTNNBL	Repeat	25	191	1.9e-143	479.1	Catenin-beta-like, Arm-motif containing nuclear
`XP_057807305.1`	Pfam	`PF08216`	CTNNBL	Repeat	188	447	1.9e-143	479.1	Catenin-beta-like, Arm-motif containing nuclear

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951321.1
ATTTTTCATATTTGGTTGGGTCGAGGCAATATGAGAGCCCAATTGATTTCCAAGCACCCATCATATTCATATCACAGAATCATCCTCTTTTAAAAAAATAAAGTTAGGGCTTCCGATTTTGCCGGAAAAAACAAAATCCTAACGGAACGGCCACGTAATGGAGCTACCGCCGCCTCAGAAACGAATGCGCTCCGGCTCCCCAGCATTCGACGCCCCTATCGACCTCTCGCTCCTCGAAGCCCTCGAGAAATCGCAGCAGA...

XM_057951322.1
TTTTCATATTTGGTTGGGTCGAGGCAATATGAGAGCCCAATTGATTTCCAAGCACCCATCATATTCATATCACAGAATCATCCTCTTTTAAAAAAATAAAGTTAGGGCTTCCGATTTTGCCGGAAAAAACAAAATCCTAACGGAACGGCCACGTAATGGAGCTACCGCCGCCTCAGAAACGAATGCGCTCCGGCTCCCCAGCATTCGACGCCCCTATCGACCTCTCGCTCCTCGAAGCCCTCGAGAAATCGCAGCAGAAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021989
ATGGAGCTACCGCCGCCTCAGAAACGAATGCGCTCCGGCTCCCCAGCATTCGACGCCCCTATCGACCTCTCGCTCCTCGAAGCCCTCGAGAAATCGCAGCAGAACGCCATCGAAACCCTCGACCTTAAAACCTTAAAGAGGCTCGCCCTCTCGTTGGAGCGCCGCCTCAACGCCAACACCGCCGCCCGCCTCAAGTACCCGGACAACCCGGAGAAGTTCGCCGATTCCGAGCTCGAGCTCCACGAAGAGCTACAGAAGCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807304.1
MELPPPQKRMRSGSPAFDAPIDLSLLEALEKSQQNAIETLDLKTLKRLALSLERRLNANTAARLKYPDNPEKFADSELELHEELQKLKILAGAPELYSDLVSLGTVNSLTGLLNHDNTDIAIDAVTLLQDLTDADVIEDNEESAQVLVDALIENNAVELLVQNLARLNDSDPDESAAIYNTLSTIENLIEVKPSASELVCEKTKLLKWLQARIKIREFDSNKQYASEILAILLQNSAANQKRFGQMNGVDTLLQAVAMYK...

XP_057807305.1
MELPPPQKRMRSGSPAFDAPIDLSLLEALEKSQQNAIETLDLKTLKRLALSLERRLNANTAARLKYPDNPEKFADSELELHEELQKLKILAGAPELYSDLVSLGTVNSLTGLLNHDNTDIAIDAVTLLQDLTDADVIEDNEESAQVLVDALIENNAVELLVQNLARLNDSDPDESAAIYNTLSTIENLIENSAANQKRFGQMNGVDTLLQAVAMYKSKDPKTGDEEEMVENLFDCLCCVLMPLENKERFVKAEGVELMII...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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