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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002931`

染色体: Chr04 坐标: 45575146-45578716 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002931`
名称	SmilChr04G002931
描述	WAT1-related protein At3g02690, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45575146 - 45578716 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020096`
GeneID	`131020096`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020096`
原始查询	`SmilChr04G002931`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WAT1-related protein At3g02690, chloroplastic
产物	WAT1-related protein At3g02690%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G02690` (AT3G02690) nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821274] identity=62.3; qcov=0.969; evalue=3.69e-161; confidence=high
Rice	`Os10g0493900` - identity=79.8; qcov=0.377; evalue=7.29e-88; confidence=low
GO	GO:0009507 (chloroplast); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00892 (EamA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020096

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804739.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057804739.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804739.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804739.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804739.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45575679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr4:45575684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr4:45575728`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C62
`Chr4:45575728`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C62
`Chr4:45578205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr4:45578294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr4:45578392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C28
`Chr4:45578529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804739.1

419 aa

210

419

EamA

PF00892 EamA 131-259 aa PF00892 EamA 276-414 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804739.1`	Pfam	`PF00892`	EamA	Domain	131	259	1.1e-47	162.4	EamA-like transporter family
`XP_057804739.1`	Pfam	`PF00892`	EamA	Domain	276	414	1.1e-47	162.4	EamA-like transporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948756.1
AACGATTTCATTACGGATATGTTTCTGTTGCTCACTCAACTAAACTGTGTGTGCACTGCACACTTCGTCACCACATCCACATATAATCAATGGAAATAAAGGTTTTGTGTCCATGAGAATCACTATAATATCCAAAAGATGGCGTGGAATTGCTGCTGTAGCTCCTCCTTCACCGCCACCACTTCGGCGGCGGTCGTTCCCGCCATTTACGCCGCCGCAAGAACTCCGAACAGCTTCACAATTACTCTTCGGAGAAATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020096
ATGGCGTGGAATTGCTGCTGTAGCTCCTCCTTCACCGCCACCACTTCGGCGGCGGTCGTTCCCGCCATTTACGCCGCCGCAAGAACTCCGAACAGCTTCACAATTACTCTTCGGAGAAATAATGCGTCCTCACAATCGCAGTCGATAAGGAACCCTATAAATCAAATCGGTTCGCCCAATTTCATAGCGAGGAGCAAGGCCACAGAATCGGAGTTTAAAACTGATTCCTCGCCGTCCAATGAGATCGACTGTATAGGCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804739.1
MAWNCCCSSSFTATTSAAVVPAIYAAARTPNSFTITLRRNNASSQSQSIRNPINQIGSPNFIARSKATESEFKTDSSPSNEIDCIGTGLDVECVINPTDDQSENSEQVGGETRETTSALVELAVTALEWGLLISPFFFWGTAMVAMKEVIPKTGPFVVAAYRLIPSGLLLVGFAASRGRSFPSGFNAWLSISVFAAIDASCFQGFLAEGLERTTAGLGSVIIDSQPLTVAILASLLFGESIGYIGAAGLVLGVIGLLLLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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