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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002940`

染色体: Chr04 坐标: 45633190-45639703 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002940`
名称	SmilChr04G002940
描述	probable metal-nicotianamine transporter YSL7
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45633190 - 45639703 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023750`
GeneID	`131023750`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023750`
原始查询	`SmilChr04G002940`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable metal-nicotianamine transporter YSL7
产物	probable metal-nicotianamine transporter YSL7
Arabidopsis	`AT1G65730` (YSL7) YELLOW STRIPE like 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842884] identity=76.5; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0674600` (OsYSL10) - identity=67.5; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0035673 (oligopeptide transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF03169 (OPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023750

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057809305.1`
2	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057809305.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057809305.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809305.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809305.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45633348`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A2,A21,A6,A7,B107,B112,B126,B130,B132,B136,B17,B20,B35,B55,B62,B63,C10,C11,C23,C53,C69,C71,C80,D5
`Chr4:45633351`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A2,A21,A6,A7,B107,B112,B126,B130,B132,B136,B17,B20,B35,B55,B62,B63,C10,C11,C23,C53,C69,C71,C80,D5
`Chr4:45633417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B68
`Chr4:45633438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39
`Chr4:45633441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,C42,C73
`Chr4:45633462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,C13,D11
`Chr4:45633501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B136
`Chr4:45633747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr4:45633891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr4:45633942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B27
`Chr4:45633951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B88
`Chr4:45633983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809305.1

699 aa

350

699

OPT

PF03169 OPT 51-669 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809305.1`	Pfam	`PF03169`	OPT	Family	51	669	2.9e-168	562.1	OPT oligopeptide transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953322.1
AAAACAGTCTTGGTGTGGCAAGTTGCATTATCCTCACCCCCAAAATGAAAGCAACAATGTAATGCATTGTCCCCTTGGTATGGCCTAGTGGTTGGGGTGGTTGTCTGTTGTCCAAGAGGTCACATGTTCGAATACTCCCGGCCACAATAATCATTAGGGGGTGTGTGGTTTGTATTATTTATAATGTAATTTCATAAAAAAAAAAAACAATGTAATGCATTCACACACATACGGAGTCAAGCAGTAGTGTGACTGCGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023750
ATGGATCGGTCCTCCAGCACCAAGAAGAAGACCGACGGGGAAGACGGCGAGAGGAATCTCGCGGCGGCGCAGGAAGACCGGGCCAACGGCGTTGAGGATGAGTCGGTGGAGAGGATTTTCGAGAGCAAGGAGGTGCCGTCGTGGCAGATGCAGCTCACGCTGCGGTCGTTCGTGGTGAGCTTCATTCTATCAATTCTGTTCACGTTCATCGTGATGAAGCTGAATCTCACGACTGGGATCATCCCGTCGCTCAACGTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809305.1
MDRSSSTKKKTDGEDGERNLAAAQEDRANGVEDESVERIFESKEVPSWQMQLTLRSFVVSFILSILFTFIVMKLNLTTGIIPSLNVSAGLLGFFFVKTWTKFLEKSGFLKQPFTRQENTVIQTCVVASSGIAFSGGFGSYLFGMSEAIAKQTTEDNNPQNVKNPQLSWMIGFLFVVSFLGLFSVVPLRKIMIIDFKLTYPSGTATAHLINSFHTPLGAKLAKKQVRTLGKFFSFSFLWGFFQWFFTAADSCGFVNFPTFG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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