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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002941`

染色体: Chr04 坐标: 45694240-45696146 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002941`
名称	SmilChr04G002941
描述	2-methylpropanoate--CoA ligase CCL4-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45694240 - 45696146 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023751`
GeneID	`131023751`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023751`
原始查询	`SmilChr04G002941`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2-methylpropanoate--CoA ligase CCL4-like
产物	2-methylpropanoate--CoA ligase CCL4-like
Arabidopsis	`AT5G16340` (AT5G16340) AMP-dependent synthetase and ligase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831495] identity=63.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0674700` - identity=64.1; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00501 (AMP-binding); PF13193 (AMP-binding_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023751

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	1.00000	`XP_057809306.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809306.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809306.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809306.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809306.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45694720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:45694778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B90,B92,C31,C81
`Chr4:45695136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:45695588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:45695700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B53,C76,D8
`Chr4:45695718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:45695727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr4:45695808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:45695831`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B20
`Chr4:45695831`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B20
`Chr4:45695837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C14,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809306.1

548 aa

274

548

AMP-binding

AMP-binding_C

PF00501 AMP-binding 21-398 aa PF13193 AMP-binding_C 449-526 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809306.1`	Pfam	`PF00501`	AMP-binding	Family	21	398	4.1e-77	260.3	AMP-binding enzyme
`XP_057809306.1`	Pfam	`PF13193`	AMP-binding_C	Domain	449	526	2.3e-23	83.6	AMP-binding enzyme C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953323.1
TTTGAATTAAAAATTATCACAACTAATTCATAATTAATACACTTGAAATGATAATTGATGTCCAAACCACTGGTTATACCCTATATATATACATATATATATGTCAACCGTACAAAGCACACATCGGTAGAGAGAGAGAGAGAGGCTTATTAAGTGATGGACGAGTTGAAACCGAGATCTGCTAACTCATGCCCCCTCACCCCTCTAACATTCCTACAACGCGCCGCCCTCGTATACGGCGACTGCCCTTCCCTGGTCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023751
ATGGACGAGTTGAAACCGAGATCTGCTAACTCATGCCCCCTCACCCCTCTAACATTCCTACAACGCGCCGCCCTCGTATACGGCGACTGCCCTTCCCTGGTCTACAACGCCACCACCTACACCTGGTCCCAAACCCACTCCCGATGCCTCCGCGCCGCCTCCGCCATCGCCTCCTTGGGCTTGGGCCGGGGTGCCGTGGTGTCGGTGGTGGCGCCCAACATCCCCGCCATGTACGAGCTCCAATTCGCCGTGCCCATGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809306.1
MDELKPRSANSCPLTPLTFLQRAALVYGDCPSLVYNATTYTWSQTHSRCLRAASAIASLGLGRGAVVSVVAPNIPAMYELQFAVPMAGCILNNINTRLDARSISVILRHSESKAVFVDSHLRSLLLQSTSLLPPAAPRPILILITDIDDPRDHNQFLDYEEMLQSGSANFEWVTPASEWDPMTLNYTSGTTSSPKGVVHSHRSIFIITSDSLINWSVPKQPVYLWTLPMFHSNGWSYTWGMAAVGGINICLRRFDAAAVY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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