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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002943`

染色体: Chr04 坐标: 45730636-45732886 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002943`
名称	SmilChr04G002943
描述	2-methylpropanoate--CoA ligase CCL4-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45730636 - 45732886 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023752`
GeneID	`131023752`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023752`
原始查询	`SmilChr04G002943`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2-methylpropanoate--CoA ligase CCL4-like
产物	2-methylpropanoate--CoA ligase CCL4-like
Arabidopsis	`AT5G16370` (AAE5) acyl activating enzyme 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831498] identity=64.6; qcov=0.885; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0674700` - identity=64.3; qcov=0.869; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00501 (AMP-binding); PF13193 (AMP-binding_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023752

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809307.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057809307.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057809307.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809307.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809307.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45731130`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B47
`Chr4:45731130`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B47
`Chr4:45731184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C24,C6,C70
`Chr4:45731187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C24,C6,C70
`Chr4:45731195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C24,C6,C70
`Chr4:45731199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C24,C6,C70
`Chr4:45731272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,C24,C6,C70
`Chr4:45731279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B69,C24,C6,C70
`Chr4:45731297`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	C24,C6,C70
`Chr4:45731297`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	C24,C6,C70
`Chr4:45731301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C24,C6,C70
`Chr4:45731370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809307.1

619 aa

310

619

AMP-binding

AMP-binding_C

PF00501 AMP-binding 94-473 aa PF13193 AMP-binding_C 524-601 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809307.1`	Pfam	`PF00501`	AMP-binding	Family	94	473	6.2e-76	256.4	AMP-binding enzyme
`XP_057809307.1`	Pfam	`PF13193`	AMP-binding_C	Domain	524	601	7e-24	85.3	AMP-binding enzyme C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953324.1
TGGTGGGTAGATTATGTAATTTATTTGATTTGGTCTATCTACTGTAGGTATTCCATATTTAATGCCCTAGATTGGTAATATACATTTCTACCCCTCTCATTACTCTGTTACATGGGCAGCCTCGCTATTAATAAACTGTATATGCCGACAGAACTCCTCCAAAAACAGAAGATCACAATTAATCATGTACACTCTCTCCCACTCACACATCTCAATCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGCCCTCTCCCTTCCAACAAAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023752
ATGTACACTCTCTCCCACTCACACATCTCAATCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGCCCTCTCCCTTCCAACAAAAACCAGCTCTGGCATGGCTCAACCAGCGCTCTAAACTACTAGGTTCCACCATAACAGTAAGTACATGCATCAAAGCATCACTGTCATACTCCCTCTCCAACCCTCCCACTCCCAACAACGCCCTACTCCCTCCAGAAACCAAAACCGCCGAGAAGGTACAACCCAGAAGATCAGCAAACTCAACCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809307.1
MYTLSHSHISISSSSSSSPSPFQQKPALAWLNQRSKLLGSTITVSTCIKASLSYSLSNPPTPNNALLPPETKTAEKVQPRRSANSTPLTPLNYLERAAVVYGDCPAIIYNDTVRTWSETYTRCLKLASSIVALGVKRDDVVSVVAPNVPAMSELHFAVPMAGAVLNTINLRLDANAISNLLQHSGSKLIFADCQSESLVHEAVSLFPPHLHRPILVLIGDDACESCSVDCCIDYENMVESGDAAFQWLRPHSEWDPITLN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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