Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002944`

染色体: Chr04 坐标: 45752997-45754427 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002944`
名称	SmilChr04G002944
描述	glutenin, high molecular weight subunit PW212-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45752997 - 45754427 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023508`
GeneID	`131023508`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023508`
原始查询	`SmilChr04G002944`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutenin, high molecular weight subunit PW212-like
产物	glutenin%2C high molecular weight subunit PW212-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0292200` - identity=26.9; qcov=0.224; evalue=2.98e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023508

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809033.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	1.00000	`XP_057809033.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057809033.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.60000	`XP_057809033.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057809033.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45753012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr4:45753023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B27,B57
`Chr4:45753029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:45753062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A25,B35,B64,C34
`Chr4:45753074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B20,B7,C58
`Chr4:45753107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D10
`Chr4:45753107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:45753108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B129
`Chr4:45753118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B125,B90,B92,C87
`Chr4:45753119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B33,D10
`Chr4:45753184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B1,B22,B69,B93
`Chr4:45753255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B129,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953050.1
ATGAACCAGGTGGAGCCCCCACCCGTTCAAGCACCACCAGTTCAAGCACTGCCAGCTCAGGCATCGCCAGCAGAAGGATGTGGCATATGTGGCGATTTTAGCCACGGAACCAACGAGTGCCACCGAATGGGGGAGTTCACGCCTGAAGGGGAGGCAGAGGTCTATGCTGCTCAGGGATACCCAGGGAGGCCTCAATTTGAACAGAGGCCCATGTATAACCAAGGGCAACAAAATTCCAACTCGGGTTGGGGAACCCAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023508
ATGAACCAGGTGGAGCCCCCACCCGTTCAAGCACCACCAGTTCAAGCACTGCCAGCTCAGGCATCGCCAGCAGAAGGATGTGGCATATGTGGCGATTTTAGCCACGGAACCAACGAGTGCCACCGAATGGGGGAGTTCACGCCTGAAGGGGAGGCAGAGGTCTATGCTGCTCAGGGATACCCAGGGAGGCCTCAATTTGAACAGAGGCCCATGTATAACCAAGGGCAACAAAATTCCAACTCGGGTTGGGGAACCCAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809033.1
MNQVEPPPVQAPPVQALPAQASPAEGCGICGDFSHGTNECHRMGEFTPEGEAEVYAAQGYPGRPQFEQRPMYNQGQQNSNSGWGTQQNSGWRNQAPGQGSGPNQGNQFRRPPQQFGYQNQQPIYPPQQQFPFPQQQSYPPGMESQSATIKRLETTVGQLSGTLNQMQQQQQPGKLHGQGLQPHQAQAVTVLRSGKVVNNKVEAPVEEPPKEARMEEQVKEPLQPREEEKEKEEEPEVKLHKAAKPYKPPVPYPSRLKNEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器