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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002958`

染色体: Chr04 坐标: 45951021-45951695 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002958`
名称	SmilChr04G002958
描述	uncharacterized SmilChr04G002958
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45951021 - 45951695 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023764`
GeneID	`131023764`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023764`
原始查询	`SmilChr04G002958`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02178 (AT_hook)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023764

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809327.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057809327.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057809327.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057809327.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809327.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45951155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr4:45951156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B135,B49
`Chr4:45951198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	80	A1,A10,A11,A14,A16,A23,A25,A5,A8,B1,B100,B102,B11,B113,B121,B123,B131,B133,B134,B135,B139,B15,B16,B17,B18,B19,B23,B24,B25,B26,B27,B3,B35,B36,B40,B41,B45,B51,B55,B57,B61,B62,B66,B7,B71,B74,B75,B83,B85,B87,B88,B9,B92,B97,B99,C17,C23,C26,C27,C30,C32,C38,C50,C51,C53,C62,C64,C66,C68,C74,C75,C78,C79,C80,C81,C87,D1,D2,D6,D9
`Chr4:45951274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:45951281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr4:45951288`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	B117,B38,B39,B50,B82,B88,B99,C13,C27,C48,C85,D7
`Chr4:45951298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr4:45951315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B69,B9,C5,C77
`Chr4:45951333`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B31,C29,C6,C79
`Chr4:45951333`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B31,C29,C6,C79
`Chr4:45951347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B86,C26
`Chr4:45951354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809327.1

140 aa

140

AT_hook

PF02178 AT_hook 6-17 aa PF02178 AT_hook 112-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809327.1`	Pfam	`PF02178`	AT_hook	Motif	6	17	0.0027	18.1	AT hook motif
`XP_057809327.1`	Pfam	`PF02178`	AT_hook	Motif	112	122	0.0027	18.1	AT hook motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953344.1
TGAAAAAGTCGAGATGCCTAAACCTGACAAGAAGAAAAGAGGAAGGCCAAGGAAGGACAAGCCCTCAACCTCCCAAGCACCAGCCCAAGCAACCTCTCAAGCACCAGCCCAAGCAACCTCTCAAGCACCAGCCCAAGAAACCTCTCAAGCACCAAACCAAGCAACCTCTCAAGCACCAAACCAAGCACCATCCACAGCTCAAAGTAGTGTTACAGCTGCCACCATTTCAAGGGAAATAAATTTCTCCAAGAAAGGAGTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023764
ATGCCTAAACCTGACAAGAAGAAAAGAGGAAGGCCAAGGAAGGACAAGCCCTCAACCTCCCAAGCACCAGCCCAAGCAACCTCTCAAGCACCAGCCCAAGCAACCTCTCAAGCACCAGCCCAAGAAACCTCTCAAGCACCAAACCAAGCAACCTCTCAAGCACCAAACCAAGCACCATCCACAGCTCAAAGTAGTGTTACAGCTGCCACCATTTCAAGGGAAATAAATTTCTCCAAGAAAGGAGTTGGAGTGTACACGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809327.1
MPKPDKKKRGRPRKDKPSTSQAPAQATSQAPAQATSQAPAQETSQAPNQATSQAPNQAPSTAQSSVTAATISREINFSKKGVGVYTNLATGNVYFQGRRITRGSTSQPPARGRGRGRPRRTIDVVTTQESVARAPGDGQV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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