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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002966`

染色体: Chr04 坐标: 46022143-46022916 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002966`
名称	SmilChr04G002966
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 9-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46022143 - 46022916 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023513`
GeneID	`131023513`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023513`
原始查询	`SmilChr04G002966`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 9-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 9-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=26.6; qcov=0.786; evalue=1.52e-14; confidence=low
Rice	`Os03g0718200` - identity=27.1; qcov=0.805; evalue=1.06e-19; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023513

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809039.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057809039.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809039.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809039.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809039.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46022157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C20
`Chr4:46022181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:46022449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B68,C80,D10
`Chr4:46022462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B23,B58,C2,C20
`Chr4:46022469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:46022485`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B127,B16,B21,C62
`Chr4:46022485`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B127,B16,B21,C62
`Chr4:46022499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B54,C58,D11,D6
`Chr4:46022536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B54,C58,D6
`Chr4:46022570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:46022573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,C42,C73
`Chr4:46022592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A8,B113,B117,B13,B26,B3,B41,B48,B60,B67,B68,C23,C80,C83,D10,D11

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953056.1
ATGGAGTTTGAGGATACGTGGAGGGAGATGATTGAAACGTATGAGTTAGAGAATCACAGCTGGTTTTCAGGTATTTATAGGCTTCGTAGTAGGTGGGCGACTATTTTCACAAGAGGCATTTTCACAGCAGGACTATTGGCAACATTACAGAGTGAGTCTATGAATAGGGTTTTGAAAGACGTATGTCGCGCCAGTTTGTCTTTATTTGAGTTTGTCAAAGAGTACAAAGCTATTCAATCCAGGTGGCGAGTTAAAGAACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023513
ATGGAGTTTGAGGATACGTGGAGGGAGATGATTGAAACGTATGAGTTAGAGAATCACAGCTGGTTTTCAGGTATTTATAGGCTTCGTAGTAGGTGGGCGACTATTTTCACAAGAGGCATTTTCACAGCAGGACTATTGGCAACATTACAGAGTGAGTCTATGAATAGGGTTTTGAAAGACGTATGTCGCGCCAGTTTGTCTTTATTTGAGTTTGTCAAAGAGTACAAAGCTATTCAATCCAGGTGGCGAGTTAAAGAACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809039.1
MEFEDTWREMIETYELENHSWFSGIYRLRSRWATIFTRGIFTAGLLATLQSESMNRVLKDVCRASLSLFEFVKEYKAIQSRWRVKEREEDTHCIFLPGQFVEGNELAKQVAIVYTRTVYKIFEGEMTHSFNVILNEVLEEVGSKLLYSDASAVSESCVRNITFDLINNHACCTYAKLRTSFPANEAMDGDIMEYMLFVNQCMRQVYDIATSTKDWMLLEH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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