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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002970`

染色体: Chr04 坐标: 46061248-46066693 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002970`
名称	SmilChr04G002970
描述	serine/threonine-protein phosphatase 7
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46061248 - 46066693 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023773`
GeneID	`131023773`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023773`
原始查询	`SmilChr04G002970`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein phosphatase 7
产物	serine/threonine-protein phosphatase 7
Arabidopsis	`AT5G63870` (PP7) serine/threonine phosphatase 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836507] identity=73; qcov=0.885; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0513000` (OsPP103) - identity=70.3; qcov=0.337; evalue=9.87e-65; confidence=low
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF00149 (Metallophos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023773

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057809339.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057809339.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057809339.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809339.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809339.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46062961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B20,C10
`Chr4:46064556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:46066096`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B105
`Chr4:46066096`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B105
`Chr4:46066154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B68
`Chr4:46066248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,C42,C73
`Chr4:46066424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B68
`Chr4:46066426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:46066505`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A16,A20,A7,B118,B126,B137,B140,B15,B23,B27,B32,B40,B42,B49,B60,B76,B83,B85,C1,C12,C18,C19,C2,C26,C37,C5,C51,C53,C58,C64,D10,D5,D7
`Chr4:46066547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr4:46066552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C7
`Chr4:46066566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809339.1

460 aa

230

460

Metallophos

PF00149 Metallophos 123-348 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809339.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	123	348	1.2e-32	114.6	Calcineurin-like phosphoesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953356.1
TAAACTTTTAATTAATTATATTATATATGAAGAATTGGTATAGCATCAAAGCCACGCTGGCACAGCATCACAGCACAGGCAACAGCCATGCTCCCATCACCACCACAGGTGGCTGCTCCTCCACCGCCGCCCTCCTCCGACGAGGACTTCTTCTCCACCGCCTCAACTTCCACTTCCTCCGATTCCAAGCCACAGTCCCCATCCCCCACGCCTCTCTCCCATCTCCCTCAGATCCCCATCGTATGGCCCGACGACGGCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023773
ATGCTCCCATCACCACCACAGGTGGCTGCTCCTCCACCGCCGCCCTCCTCCGACGAGGACTTCTTCTCCACCGCCTCAACTTCCACTTCCTCCGATTCCAAGCCACAGTCCCCATCCCCCACGCCTCTCTCCCATCTCCCTCAGATCCCCATCGTATGGCCCGACGACGGCGCTCTCTCCGCCTCCTGGGTCGCCGACCTCATGCAGGCCTTCGAATGGGCTTCCAGAACTCTTCCGCCCTCCGAGTTGCCCTCCGTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809339.1
MLPSPPQVAAPPPPPSSDEDFFSTASTSTSSDSKPQSPSPTPLSHLPQIPIVWPDDGALSASWVADLMQAFEWASRTLPPSELPSVLPVAVFDKLVLTASKILHKEPNCVRIDENSGLNSDCRVVVVGDVHGQLHDVLFLLRNAGFPADDRFFVFNGDYVDRGAWGLEVFLLLLAWKVLMPHRVFLLRGNHESKYCTSVYGFEKEVLVKYGDNGKHVYRKCLGCFEGLPLASIIAGQVYTAHGGLFRGTIITPSKRSKKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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