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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002974`

染色体: Chr04 坐标: 46102961-46103868 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002974`
名称	SmilChr04G002974
描述	transcription factor DIVARICATA-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46102961 - 46103868 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023514`
GeneID	`131023514`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023514`
原始查询	`SmilChr04G002974`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor DIVARICATA-like
产物	transcription factor DIVARICATA-like
Arabidopsis	`AT5G58900` (AT5G58900) Homeodomain-like transcriptional regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836007] identity=48.6; qcov=0.641; evalue=3.15e-49; confidence=medium
Rice	`Os01g0853700` - identity=46.1; qcov=0.652; evalue=4.6e-48; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023514

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809040.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809040.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809040.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809040.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809040.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46102973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr4:46103025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr4:46103147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr4:46103162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr4:46103312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B103,B46,C41
`Chr4:46103705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B20,C10
`Chr4:46103859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809040.1

276 aa

138

276

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 41-85 aa PF00249 Myb_DNA-binding 130-175 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809040.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	41	85	1.3e-21	77.2	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057809040.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	130	175	1.3e-21	77.2	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953057.1
ATGGAATGGCCAGCTGATTTCCATTGCTCCCCCTTGGATGAATCTCTATACAGCCTCCTTTCACCCTCACCACCCCCACCACCCCCACCATCTCTATCAGAAATGCCTAAACCATCAAGGGAGTGGAACAGTGAGGAAAACAAGGTGTTCGAGAACGCCTTGGCGGAGTTGGATCATTCTTCCCCAACCTTCTTCGAGAGTATTGCATCCAAGGTTCCATGGCGATCCATTGAAGACATCAAGCTCCACTACCAAGCACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023514
ATGGAATGGCCAGCTGATTTCCATTGCTCCCCCTTGGATGAATCTCTATACAGCCTCCTTTCACCCTCACCACCCCCACCACCCCCACCATCTCTATCAGAAATGCCTAAACCATCAAGGGAGTGGAACAGTGAGGAAAACAAGGTGTTCGAGAACGCCTTGGCGGAGTTGGATCATTCTTCCCCAACCTTCTTCGAGAGTATTGCATCCAAGGTTCCATGGCGATCCATTGAAGACATCAAGCTCCACTACCAAGCACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809040.1
MEWPADFHCSPLDESLYSLLSPSPPPPPPPSLSEMPKPSREWNSEENKVFENALAELDHSSPTFFESIASKVPWRSIEDIKLHYQALVQDIEMIESGNFPIPDYPTLDLQPKPDDDSKNKTGPPRRRGIPWTEEEHQLFLMGLNKYGKGDWRSISRYYVITKTPTQVASHAQKYFRRQTSSTPADRRRPSIHDIHTVSPAAAAFASPSLPNPIPFPPSALIPALHQNYPNLAQNPSFLQQPPLNAAPAHAMFNQAAHPSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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