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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002977`

染色体: Chr04 坐标: 46156568-46157619 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002977`
名称	SmilChr04G002977
描述	RING-H2 finger protein ATL80-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46156568 - 46157619 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023785`
GeneID	`131023785`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023785`
原始查询	`SmilChr04G002977`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-H2 finger protein ATL80-like
产物	RING-H2 finger protein ATL80-like
Arabidopsis	`AT1G20823` (AT1G20823) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838674] identity=56.7; qcov=0.988; evalue=1.15e-56; confidence=high
Rice	`Os02g0832150` (OJ1149_C12.20) - identity=44.9; qcov=0.94; evalue=8.06e-40; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF12678 (zf-rbx1); PF12861 (zf-ANAPC11); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF14634 (zf-RING_5); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023785

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057809357.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057809357.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057809357.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809357.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809357.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46156991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B68
`Chr4:46157110`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	C14,C15,C20,C21,C50,C51,C59,C81
`Chr4:46157143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:46157144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr4:46157147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B68
`Chr4:46157190`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B128
`Chr4:46157190`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B128
`Chr4:46157309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,C13,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809357.1

166 aa

166

zf-RING_11

zf-C3HC4_2

zf-RING_2

zf-RING_5

zf-C3HC4

zf-rbx1

zf-ANAPC11

PF17123 zf-RING_11 103-132 aa PF13923 zf-C3HC4_2 103-145 aa PF13639 zf-RING_2 103-146 aa PF14634 zf-RING_5 103-147 aa PF00097 zf-C3HC4 104-145 aa PF12678 zf-rbx1 107-146 aa PF12861 zf-ANAPC11 113-151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809357.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	103	132	9e-12	45.2	RING-like zinc finger
`XP_057809357.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	103	145	3.9e-10	40.1	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057809357.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	103	146	6.6e-16	59.0	Ring finger domain
`XP_057809357.1`	Pfam	`PF14634`	zf-RING_5	Domain	103	147	2.2e-06	28.2	zinc-RING finger domain
`XP_057809357.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	104	145	3.1e-08	34.1	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057809357.1`	Pfam	`PF12678`	zf-rbx1	Domain	107	146	1.9e-08	35.1	RING-H2 zinc finger domain
`XP_057809357.1`	Pfam	`PF12861`	zf-ANAPC11	Domain	113	151	2.5e-06	28.1	Anaphase-promoting complex subunit 11 RING-H2 finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953374.1
TGAATAATAAATTTTAATTTCGTTGATACTTAATAATAATTGAATCCGAACTTTGAGTAGTCGGTACAACGTCCAATTTATGAATGGTAATGAAAAATAATTTTAAATGTATAATTATTATTCTACAAAATTTAAAAGTTTTAAACCCCTCTGCTTTCTCTCTCTAAAGAGAAGTATATAGAGATTTGAAGGGATAAGGAGAGTGGTGATGAATAATGACTCCTACACCTCTAAACTCATTCTCTCTCTCAGTCTCAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023785
ATGACTCCTACACCTCTAAACTCATTCTCTCTCTCAGTCTCAGCTACAAACTCATCGCCCTCGCATCAGAACCCGGCTGAGCCGCCGTATGCCGCCGGCGTCGAATCTGACTTCGTAATTATTCTGGCGGCTCTGCTCTGCACTGTTATTTCCGTCGTCGGTCTCATCTCCGTAGCTCGATGCGCCTGGCTCCGCCGCCGAAGCCGGAACAGCGAACAACCGCCGGCGGACAGAGGCCTAAACAAAAAGGCAGTGCAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809357.1
MTPTPLNSFSLSVSATNSSPSHQNPAEPPYAAGVESDFVIILAALLCTVISVVGLISVARCAWLRRRSRNSEQPPADRGLNKKAVQSLPKFTFSSSSGGGAAECAICLAEYADGDEVRVLPQCGHGFHIECVDTWLRSHSSCPSCRQILLVSRCHKCADETELGNC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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