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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002986`

染色体: Chr04 坐标: 46266040-46270681 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002986`
名称	SmilChr04G002986
描述	protein PIN-LIKES 7-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46266040 - 46270681 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023787`
GeneID	`131023787`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023787`
原始查询	`SmilChr04G002986`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PIN-LIKES 7-like
产物	protein PIN-LIKES 7-like
Arabidopsis	`AT5G65980` (AT5G65980) Auxin efflux carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836728] identity=56.1; qcov=1.01; evalue=3.27e-164; confidence=high
Rice	`Os09g0554300` (OsPILS7a) - identity=49.6; qcov=1.1; evalue=9.14e-150; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0080162 (endoplasmic reticulum to cytosol auxin transport)
KEGG	-
Pfam	PF03547 (Mem_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023787

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057809360.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057809360.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057809360.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057809360.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057809360.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46266277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A1,A2,B110,B113,B13,B137,B138,B22,B30,B42,B43,B80,B94,C53,C76,D6
`Chr4:46266319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C71
`Chr4:46266374`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A22,A23,B100,B109,B125,B138,B25,B47,B5,B57,B58,B59,B60,B77,C13,C15,C20,C21,C22,C24,C27,C36,C86,D1
`Chr4:46266471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C34
`Chr4:46266551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B7
`Chr4:46266739`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B11,B133,B46,B57,C51
`Chr4:46266739`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B11,B133,B46,B57,C51
`Chr4:46266776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809360.1

391 aa

196

391

Mem_trans

PF03547 Mem_trans 10-382 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809360.1`	Pfam	`PF03547`	Mem_trans	Family	10	382	1.1e-81	274.9	Membrane transport protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953377.1
GGGGCCAATAAAGAAATTATAAACATGTGAAATCCCATTGCCAACTCTTCCTTTGCTATATTTACGCAGACTATATGGCTATAGCTATTAAATGACGAGTCATCACCTACCACTCGCCTATATATATATTCATCCACAATAATATTACTCATAACACCACAATTTAACACAACATACAGCAACATCAGGCTGCAAATTCTCTCACTAAAATTAGAGATAGAAGAAAAAGTTGTATTAAAAAATGGGGTTGTTATCACTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023787
ATGGGGTTGTTATCACTGTTGGGGGTGTCGCTGATGCCGATTCTACAAGTGCTTCTGTTATGTACGTTGGGGGCTTTCATGGCTACTGACTATTTGAAGCTTTTCCCTTCTCAAACTAGAAGAGCTTTGAACCGAATAGTGTTTGCAGTGTTCACCCCAGCACTTGTATTTTCAAGCCTTGCAAAGACAGTCAGCCTCCAAGACCTTATCTCATGGTGGTTCATGCCGGTGAACATCGGAATCACGTTTCTGTTGGGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809360.1
MGLLSLLGVSLMPILQVLLLCTLGAFMATDYLKLFPSQTRRALNRIVFAVFTPALVFSSLAKTVSLQDLISWWFMPVNIGITFLLGGTLGWIACKLMKPQPYLQYLVIAMCATGNLGNIMVILIPAMCEEAGNPFGDKSTCRTLGLSYSSLSMALGCFYMWTYTYHLIQNSSAVYRSSLAAQDTPGEPNKDLEASPTTLLLHNSTRDLKPAAAVWNKLLGVSRQLMEELKAPPVVAAFIGFVFGAVSWLRNLVIGDNAPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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