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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002991`

染色体: Chr04 坐标: 46341231-46342816 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002991`
名称	SmilChr04G002991
描述	uncharacterized SmilChr04G002991
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46341231 - 46342816 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023793`
GeneID	`131023793`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023793`
原始查询	`SmilChr04G002991`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0433800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0433800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G22935` (AT3G22935) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28719306] identity=36; qcov=0.441; evalue=3.71e-10; confidence=low
Rice	`Os11g0433800` - identity=37.3; qcov=0.564; evalue=5.88e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023793

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809372.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057809372.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057809372.1`
4	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057809372.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809372.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46341481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr4:46341485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr4:46341495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr4:46341522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C28
`Chr4:46341522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr4:46341533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B128,B66,C17
`Chr4:46341552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B50,B66,B97
`Chr4:46341552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,B66,B97
`Chr4:46341558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr4:46341563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B128,B26,C17
`Chr4:46341570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr4:46341596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809372.1

195 aa

195

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 103-132 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809372.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	103	132	1.8e-06	28.5	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953389.1
AAAAAATGTTTTTCAACGGCTTTTTCGACCGTTTTTCAATTTTTTTTTTCTTCCCCAACGGCTCTTTCGTCCGTTTGCATCCATTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTAATCTTCTTTTCTCTCTATAAATAATACTTCTCCCTCATTCATTCATCACAACTCACTCCTTCTTCCTCCTACAATTTTTCTTGCAAAATATCATATTCGTTCTTCCAAAAATGTCATCACCTGAACATGATTCTTCGCCCGATTCCGACGAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023793
ATGTCATCACCTGAACATGATTCTTCGCCCGATTCCGACGAAGTCGCTGAAAAGTTCATGGAGTTGGTTGAGTTGCAGAAACAACTGCTTCAATCATACTGCCCCCAACCGGCGTCGGAGCCGGCGCGTGCGAAACGTCCCCGATCATACGTCCACCGTGATCGTGAAGAGGCCCATGTACGTCTTATGCAAGACTACTTCGTCGACAATCCAACGTACGGCCCTACTTTTTTCCAGAATCGGCACGGAAGGATGTGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809372.1
MSSPEHDSSPDSDEVAEKFMELVELQKQLLQSYCPQPASEPARAKRPRSYVHRDREEAHVRLMQDYFVDNPTYGPTFFQNRHGRMWNAPSESFKLGGESFEVRRNWYVEHLKDIMLCCIILHNMIVEHEGEAAANWRDDDGASSSGSTESAGQTPVSFEEYVRRDSLLRDRQLHAQLRYDLIEHLWARFGPLGPE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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