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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002993`

染色体: Chr04 坐标: 46348704-46355265 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002993`
名称	SmilChr04G002993
描述	rab escort protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46348704 - 46355265 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023795`
GeneID	`131023795`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023795`
原始查询	`SmilChr04G002993`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rab escort protein 1-like
产物	rab escort protein 1-like
Arabidopsis	`AT3G06540` (REP) Rab escort protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819832] identity=50.4; qcov=1.06; evalue=5.29e-171; confidence=high
Rice	`Os01g0269100` - identity=48; qcov=0.561; evalue=1.86e-75; confidence=medium
GO	GO:0005092 (GDP-dissociation inhibitor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005829 (cytosol); GO:0005968 (Rab-protein geranylgeranyltransferase complex); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0007264 (small GTPase-mediated signal transduction); GO:0016192 (vesicle-mediated transport); GO:0018344 (protein geranylgeranylation)
KEGG	-
Pfam	PF00996 (GDI); PF22603 (RAE1_2_domI_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023795

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809376.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057809376.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057809376.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809376.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809376.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46349141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C52
`Chr4:46354729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B27,B53,B75,C73,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809376.1

538 aa

269

538

GDI

RAE1_2_domI_C

PF00996 GDI 14-70 aa PF00996 GDI 84-442 aa PF22603 RAE1_2_domI_C 362-472 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809376.1`	Pfam	`PF00996`	GDI	Family	14	70	1.9e-44	152.6	GDP dissociation inhibitor
`XP_057809376.1`	Pfam	`PF00996`	GDI	Family	84	442	1.9e-44	152.6	GDP dissociation inhibitor
`XP_057809376.1`	Pfam	`PF22603`	RAE1_2_domI_C	Domain	362	472	3.4e-09	37.8	RAE1/2 domain I, C-terminal region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101530.1
CCAGTATCTATAAGTTGAACTAATGCAGTCAAAATCGTAGGAAAAGCGCCGCAATCTGCAAACCCCCGCCGCCCCGCCGCCGTGTTTATCGCTTGCTAAGGCGAACTATCAATCCGCAAAACTCACTAATGGACGATACTACGTCGTATCCGCCCATCGAGCCCTCCAATTTCGACCTTATTGTCGTCGGCACCGGCCTCCCGGAATCCATCATCGCCGCCGCCGCGTCCGCCGCCGGAAAGACCGTCCTCCACCTCGAT...

XM_057953393.1
ACTTAAGTAAATGGCGCACATTATTAACCGTATTTCCAGTATCTATAAGTTGAACTAATGCAGTCAAAATCGTAGGAAAAGCGCCGCAATCTGCAAACCCCCGCCGCCCCGCCGCCGTGTTTATCGCTTGCTAAGGCGAACTATCAATCCGCAAAACTCACTAATGGACGATACTACGTCGTATCCGCCCATCGAGCCCTCCAATTTCGACCTTATTGTCGTCGGCACCGGCCTCCCGGAATCCATCATCGCCGCCGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023795
ATGGACGATACTACGTCGTATCCGCCCATCGAGCCCTCCAATTTCGACCTTATTGTCGTCGGCACCGGCCTCCCGGAATCCATCATCGCCGCCGCCGCGTCCGCCGCCGGAAAGACCGTCCTCCACCTCGATCCCAATCCGTTCTACGGCACTCACTCGGCTTCGCTCCCCCTCGATGACTTCATCTCCTTCCTCCAATCCCAATCCGAATCGCCATCTCAGCCGCCGCTTCAAACCCCCAATGATGATGCTTCGATCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809376.1
MDDTTSYPPIEPSNFDLIVVGTGLPESIIAAAASAAGKTVLHLDPNPFYGTHSASLPLDDFISFLQSQSESPSQPPLQTPNDDASIPLTTRPLYSELEIKSYTSEPLENSRRFCLDLVAPRAFLCADAMIELILKTGINQYMEFKSVDASFVSSGGGKLESVPDSRSAIFKSRSLLGPEKYQLMNFFKHVQGVFENGSEEDLETPFVEFLTKRGLSQKLKSIILYTIAWADYDQEEMESCKDVISTKSGINRLALYHSSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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