当前解析结果
SmilChr04G002995| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002995 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002995 |
| 描述 | probable serine/threonine-protein kinase PIX13 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 46361791 - 46365576 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023797 |
|---|---|
| GeneID | 131023797 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023797 |
| 原始查询 | SmilChr04G002995 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable serine/threonine-protein kinase PIX13 |
| 产物 | probable serine/threonine-protein kinase PIX13 |
| Arabidopsis | AT2G17220 (Kin3)Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816227] identity=63; qcov=0.903; evalue=1.15e-158; confidence=high |
| Rice | Os06g0727400 (OsRLCK220)- identity=65.1; qcov=0.901; evalue=3.02e-166; confidence=high |
| GO | GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023797 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057809377.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057809377.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809377.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809377.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057809377.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057809377.1PF00069
Pkinase 85-359 aa
PF07714
PK_Tyr_Ser-Thr 87-362 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057809377.1 |
Pfam | PF00069 |
Pkinase | Domain | 85 | 359 | 1.5e-44 | 153.1 | Protein kinase domain |
XP_057809377.1 |
Pfam | PF07714 |
PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 87 | 362 | 2.2e-47 | 162.2 | Protein tyrosine and serine/threonine kinase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。