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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003003`

染色体: Chr04 坐标: 46427382-46430937 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003003`
名称	SmilChr04G003003
描述	ankyrin repeat domain-containing protein, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46427382 - 46430937 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023806`
GeneID	`131023806`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023806`
原始查询	`SmilChr04G003003`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ankyrin repeat domain-containing protein, chloroplastic-like
产物	ankyrin repeat domain-containing protein%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G66055` (AKRP) ankyrin repeat protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836737] identity=51.6; qcov=0.957; evalue=5.21e-142; confidence=high
Rice	`Os03g0135600` - identity=46.3; qcov=0.846; evalue=5.55e-111; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0009707 (chloroplast outer membrane); GO:0030941 (chloroplast targeting sequence receptor activity); GO:0045036 (protein targeting to chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF00023 (Ank); PF12796 (Ank_2); PF13606 (Ank_3); PF13637 (Ank_4); PF13857 (Ank_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023806

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809391.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057809391.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057809391.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057809391.1`
5	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057809391.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46427490`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B117,C54,C87
`Chr4:46427490`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B117,C54,C87
`Chr4:46427493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,C54,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809391.1

447 aa

224

447

Ank_2

Ank_4

Ank_5

Ank

Ank_2

Ank_5

Ank_3

Ank

Ank_2

Ank_4

Ank_3

Ank

PF12796 Ank_2 287-350 aa PF13637 Ank_4 292-330 aa PF13857 Ank_5 307-361 aa PF00023 Ank 320-352 aa PF12796 Ank_2 335-417 aa PF13857 Ank_5 344-394 aa PF13606 Ank_3 354-381 aa PF00023 Ank 354-385 aa PF12796 Ank_2 358-432 aa PF13637 Ank_4 368-407 aa PF13606 Ank_3 386-412 aa PF00023 Ank 386-418 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809391.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	287	350	3.9e-38	130.6	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057809391.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	292	330	9.2e-24	83.7	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057809391.1`	Pfam	`PF13857`	Ank_5	Repeat	307	361	5.5e-25	87.9	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057809391.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	320	352	7.2e-24	83.3	Ankyrin repeat
`XP_057809391.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	335	417	3.9e-38	130.6	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057809391.1`	Pfam	`PF13857`	Ank_5	Repeat	344	394	5.5e-25	87.9	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057809391.1`	Pfam	`PF13606`	Ank_3	Repeat	354	381	1.1e-15	56.6	Ankyrin repeat
`XP_057809391.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	354	385	7.2e-24	83.3	Ankyrin repeat
`XP_057809391.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	358	432	3.9e-38	130.6	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057809391.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	368	407	9.2e-24	83.7	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057809391.1`	Pfam	`PF13606`	Ank_3	Repeat	386	412	1.1e-15	56.6	Ankyrin repeat
`XP_057809391.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	386	418	7.2e-24	83.3	Ankyrin repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953408.1
AGAATTACAAATTTCATCCTCCCTCTCCAATCCATCACACACGCACAGCCATGTCCTCAGCAGCACCTTGGACATCAACTATTCCGCAAAAACCCCAAACCCCTGGCCCTTCACTATTCTCTCATCTCCCCCTTCCTCACTCTCGCACCATCCAATTTCATAGACTCAACCACAATCTCACCCTCAAGCCCCTCAACTCCTCTTCCCAACCTCTGTATGGCTCTGTTTCACCAGCTCCACCACAAGACGAGGACGACGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023806
ATGTCCTCAGCAGCACCTTGGACATCAACTATTCCGCAAAAACCCCAAACCCCTGGCCCTTCACTATTCTCTCATCTCCCCCTTCCTCACTCTCGCACCATCCAATTTCATAGACTCAACCACAATCTCACCCTCAAGCCCCTCAACTCCTCTTCCCAACCTCTGTATGGCTCTGTTTCACCAGCTCCACCACAAGACGAGGACGACGACGAAGAGCCCGCTATCGGTGACTGCCTCGTCTACGAAGAGGGCATCTTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809391.1
MSSAAPWTSTIPQKPQTPGPSLFSHLPLPHSRTIQFHRLNHNLTLKPLNSSSQPLYGSVSPAPPQDEDDDEEPAIGDCLVYEEGIFNDPFIENTRNSRRSGAHITKSATNKDADVSPENLIPDEWQDVQKELNITKKERRKMAQELEYGTRVAKRRQALMPLNSEGFEKTRQDKIEQMRLEKFEKIKQEKIKQLSPVVLDNPKKAYFREIKPEKETNGEVSGGRVAPRNPRLAVYGVGLEDVSAFFSSGKYESAAADKSQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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