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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003007`

染色体: Chr04 坐标: 46443566-46448065 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003007`
名称	SmilChr04G003007
描述	thiol-disulfide oxidoreductase LTO1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46443566 - 46448065 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023809`
GeneID	`131023809`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023809`
原始查询	`SmilChr04G003007`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thiol-disulfide oxidoreductase LTO1-like
产物	thiol-disulfide oxidoreductase LTO1-like
Arabidopsis	`AT4G35760` (LTO1) NAD(P)H dehydrogenase (quinone)s [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829729] identity=62.9; qcov=0.746; evalue=2.5e-128; confidence=high
Rice	`Os03g0131500` - identity=53; qcov=0.853; evalue=7.45e-115; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF07884 (VKOR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023809

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809394.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057809394.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057809394.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.80000	`XP_057809394.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809394.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46443901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C67
`Chr4:46444147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr4:46444304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr4:46444345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:46445779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B113
`Chr4:46447214`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B72,C74
`Chr4:46447214`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B72,C74
`Chr4:46447230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809394.1

399 aa

200

399

VKOR

PF07884 VKOR 103-233 aa

XP_057809395.1

394 aa

197

394

VKOR

PF07884 VKOR 103-233 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809394.1`	Pfam	`PF07884`	VKOR	Domain	103	233	1.1e-28	100.7	Vitamin K epoxide reductase family
`XP_057809395.1`	Pfam	`PF07884`	VKOR	Domain	103	233	1.1e-28	100.7	Vitamin K epoxide reductase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953411.1
ATAATTTGTAAACTTTTATTGTGGAGGGAGTAAGTGAATGAGCGAGTAGTGAGAGACAGTTGAAGCATTAGTGAGTTCCTGACCCAACTAATCTTAATTAGTCACACTTTCTTGTAAACCACGGATCCGCCTAGTCAGATTCGCCGTCATTAACCGCGCTACAACCACCGCCATACAACGGCTTCGCGCTTTCCCACCGCCGCACAACTACTGCGTCCCACAGCATCAGCGGCGCGAGCTCATGGCGGCCAAGGCGTCGA...

XM_057953412.1
GGGAGTAAGTGAATGAGCGAGTAGTGAGAGACAGTTGAAGCATTAGTGAGTTCCTGACCCAACTAATCTTAATTAGTCACACTTTCTTGTAAACCACGGATCCGCCTAGTCAGATTCGCCGTCATTAACCGCGCTACAACCACCGCCATACAACGGCTTCGCGCTTTCCCACCGCCGCACAACTACTGCGTCCCACAGCATCAGCGGCGCGAGCTCATGGCGGCCAAGGCGTCGACCAGTTTCTTCAGCATATTATCATC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131023809
ATGGCGGCCAAGGCGTCGACCAGTTTCTTCAGCATATTATCATCTCCATCATCTTCTTCTTCTTCTCTGTTTTTCCATCGGACTCCATTTCTCTGTCCGGCTTCACTCTCAGCTACTTCGCTTCCCAAATTCAAGGAAAGAATTCCGGGGCTAGGGCACGTGTTGGTTACGGTGAATTGCGTGTCGGAACGTAGCAAACAGGCTGCGGAACCGGAGCCTGAAATAGCTCCCTCGCCGTCGTCGGAATCTCCATCGTCTTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809394.1
MAAKASTSFFSILSSPSSSSSSLFFHRTPFLCPASLSATSLPKFKERIPGLGHVLVTVNCVSERSKQAAEPEPEIAPSPSSESPSSSSVAGADNDADISAYKWIVALGGIGLLETAYLTYLKLTGSDAFCPTGGGSCTTILTSDYSSVFGVPLPLFGMLAYGLVASLGLQLGMEKRTFDTGKSNGEIILVGITTSMAVASAYFLYILSTEFAGESCLYCLASATLSFSLFFITLKRFGLQEIQKILGLQLFVASLVVIAL...

XP_057809395.1
MAAKASTSFFSILSSPSSSSSSLFFHRTPFLCPASLSATSLPKFKERIPGLGHVLVTVNCVSERSKQAAEPEPEIAPSPSSESPSSSSVAGADNDADISAYKWIVALGGIGLLETAYLTYLKLTGSDAFCPTGGGSCTTILTSDYSSVFGVPLPLFGMLAYGLVASLGLQLGMEKRTFDTGKSNGEIILVGITTSMAVASAYFLYILSTEFAGESCLYCLASATLSFSLFFITLKRFGLQEIQKILGLQLFVASLVVIAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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