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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003018`

染色体: Chr04 坐标: 46557291-46562971 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003018`
名称	SmilChr04G003018
描述	uncharacterized SmilChr04G003018
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46557291 - 46562971 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023822`
GeneID	`131023822`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023822`
原始查询	`SmilChr04G003018`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833804]; symbol=AT5G38220; hit=AT5G38220; species=arabidopsis; confidence=high
产物	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833804]; symbol=AT5G38220; hit=AT5G38220; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G38220` (AT5G38220) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833804] identity=80.4; qcov=0.941; evalue=1.51e-126; confidence=high
Rice	`Os01g0689800` (OsPOP3) - identity=69.8; qcov=1.04; evalue=1.72e-115; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF03959 (FSH1); PF05677 (DUF818); PF12146 (Hydrolase_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023822

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057809410.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057809411.1`
3	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057809411.1`
4	Endosome	内体	0.40000	`XP_057809411.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057809411.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46562323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C56
`Chr4:46562401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr4:46562458`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B137
`Chr4:46562458`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B137

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809410.1

340 aa

170

340

Hydrolase_4

Abhydrolase_1

FSH1

PF12146 Hydrolase_4 65-173 aa PF00561 Abhydrolase_1 70-170 aa PF03959 FSH1 160-240 aa

XP_057809411.1

222 aa

111

222

DUF818

Hydrolase_4

Abhydrolase_1

PF05677 DUF818 55-149 aa PF12146 Hydrolase_4 65-173 aa PF00561 Abhydrolase_1 70-170 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809410.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	65	173	4.6e-14	53.0	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057809410.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	70	170	8.2e-10	39.5	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057809410.1`	Pfam	`PF03959`	FSH1	Domain	160	240	0.00022	21.7	Serine hydrolase (FSH1)
`XP_057809411.1`	Pfam	`PF05677`	DUF818	Family	55	149	0.00011	22.0	Chlamydia CHLPS protein (DUF818)
`XP_057809411.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	65	173	1.1e-09	38.8	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057809411.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	70	170	1.1e-06	29.2	alpha/beta hydrolase fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953427.1
GTTATTGTAGATAGATATATAGATTTCACAATTTTACTATCAAAAGACTTTAATTTAATACTACTTGAATTTCAATTTCAATCTAGTGTAATTTTACTCCAACGTTCGAAAATCCCGAGTCCCCATAAAACTACTAACGCCGCACTCCTTTGAAAATTCTGCTTACTTTTTTCCTTTACTCGGCCCTCTTCCACACGCGCCACCTCCCCGCGCCGGCCGCCTCTTCCCGGTTTCATTCTCCGAAAGGAGATCTCAATACG...

XM_057953428.1
ATATATAGATTTCACAATTTTACTATCAAAAGACTTTAATTTAATACTACTTGAATTTCAATTTCAATCTAGTGTAATTTTACTCCAACGTTCGAAAATCCCGAGTCCCCATAAAACTACTAACGCCGCACTCCTTTGAAAATTCTGCTTACTTTTTTCCTTTACTCGGCCCTCTTCCACACGCGCCACCTCCCCGCGCCGGCCGCCTCTTCCCGGTTTCATTCTCCGAAAGGAGATCTCAATACGACTGCGGAAGTTGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131023822
ATGGGCGGGGTGACGTCATCGATCGCGGCTAAGTTCGCCTTCTTCCCGCCGAATCCGCCTTCGTACACGGTGGTGGCCGACGAGGGCGGAGCTCTTTGCATACCGGAGGTTCCGCAGAGGGAAGGCGTCGACGTCTTGAAGCTGAGGACGCGCCGGGGGAACGATGTGGTGGCTGTGTACATCAGCCACCCCAAGGCCACCGCTACGATGCTCTATTCCCACGGTAACGCCGCCGATTTAGGTCAGATGTATGAGCTGTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809410.1
MGGVTSSIAAKFAFFPPNPPSYTVVADEGGALCIPEVPQREGVDVLKLRTRRGNDVVAVYISHPKATATMLYSHGNAADLGQMYELFVEITLRLRINLMGYDYSGYGQSSGKPSECNTYTDIDAVYKCLKEKYGVKDEQLILYGQSVGSGPTIDLASRSPNLRGVVLHSPILSGLRVLYPVKRTYWFDIYKNIDKIGSIECPVLVIHGTSDEVVDCSHGKQLWELCKVKYEPLWINGGGHCNLELYPEFIKHLKKFVLAL...

XP_057809411.1
MGGVTSSIAAKFAFFPPNPPSYTVVADEGGALCIPEVPQREGVDVLKLRTRRGNDVVAVYISHPKATATMLYSHGNAADLGQMYELFVEITLRLRINLMGYDYSGYGQSSGKPSECNTYTDIDAVYKCLKEKYGVKDEQLILYGQSVGSGPTIDLASRSPNLRGVVLHSPILSGLRVLYPVKRTYWFDIYKNIDKIGSIECPVLVIHTEGKTRRIMQQEQFC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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