当前解析结果
SmilChr04G003045| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003045 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003045 |
| 描述 | calmodulin-lysine N-methyltransferase-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 46992211 - 46998135 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023841 |
|---|---|
| GeneID | 131023841 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023841 |
| 原始查询 | SmilChr04G003045 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | calmodulin-lysine N-methyltransferase-like |
| 产物 | calmodulin-lysine N-methyltransferase-like |
| Arabidopsis | AT4G35987 (AT4G35987)S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829754] identity=59.7; qcov=0.971; evalue=8.35e-139; confidence=high |
| Rice | Os03g0243800- identity=53.6; qcov=1.01; evalue=1.21e-112; confidence=high |
| GO | GO:0005737 (cytoplasm); GO:0018025 (calmodulin-lysine N-methyltransferase activity) |
| KEGG | smil00310 (Lysine degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF05175 (MTS); PF10294 (Methyltransf_16) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023841 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057809436.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057809436.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057809436.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809436.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809436.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:46992490 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
Chr4:46997919 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B19 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057809436.1PF10294
Methyltransf_16 121-263 aa
PF05175
MTS 132-218 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057809436.1 |
Pfam | PF10294 |
Methyltransf_16 | Family | 121 | 263 | 6.6e-22 | 78.8 | Lysine methyltransferase |
XP_057809436.1 |
Pfam | PF05175 |
MTS | Domain | 132 | 218 | 9.5e-06 | 26.0 | Methyltransferase small domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。