当前解析结果
SmilChr04G003048| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003048 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003048 |
| 描述 | rhodanese-like domain-containing protein 17 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 47009493 - 47011149 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023844 |
|---|---|
| GeneID | 131023844 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023844 |
| 原始查询 | SmilChr04G003048 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | rhodanese-like domain-containing protein 17 |
| 产物 | rhodanese-like domain-containing protein 17 |
| Arabidopsis | AT2G17850 (AT2G17850)Rhodanese/Cell cycle control phosphatase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816295] identity=46.4; qcov=0.972; evalue=3.95e-40; confidence=medium |
| Rice | Os04g0249600 (STR6)- identity=58.9; qcov=0.778; evalue=7.36e-43; confidence=medium |
| GO | GO:0003824 (catalytic activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00581 (Rhodanese) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023844 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.60000 | XP_057809439.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057809439.1 |
| 3 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057809439.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057809439.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809439.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057809439.1PF00581
Rhodanese 41-131 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057809439.1 |
Pfam | PF00581 |
Rhodanese | Domain | 41 | 131 | 3.3e-15 | 57.1 | Rhodanese-like domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。