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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003057`

染色体: Chr04 坐标: 47141270-47143517 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003057`
名称	SmilChr04G003057
描述	uncharacterized SmilChr04G003057
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47141270 - 47143517 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023526`
GeneID	`131023526`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023526`
原始查询	`SmilChr04G003057`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023526

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809054.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057809054.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057809054.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809054.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809054.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47141949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C50
`Chr4:47141958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:47142022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B40
`Chr4:47142037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr4:47142093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr4:47142120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B23
`Chr4:47142123`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B118,C51
`Chr4:47142123`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B118,C51
`Chr4:47142153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr4:47142166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C70
`Chr4:47142184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C87
`Chr4:47142190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809054.1

671 aa

336

671

DUF1985

PF09331 DUF1985 29-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809054.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	29	159	2.7e-13	50.8	Domain of unknown function (DUF1985)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953071.1
CTCGAGACTAAACGAAATTGGCGGTTTTGCACTGGAGAATACGTTCAGGCATGGGTGCTTTGGGATGATGTTGGATTGGCAGCCGGGCCAGAAGTGCAATGCTGCATTGCACCATATTGTCTCTCGTCATCTTAAGATCACGAGAGACGATGAGGATGATGAGATCTGCTTCTACATCAACGGGAGGAACGTTGAGTTTACTCCGAGAGATTTCGCTCTCGTGACAGGATTGTCCTTTGGGGATGATCCTTTTGACCCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023526
ATGATGTTGGATTGGCAGCCGGGCCAGAAGTGCAATGCTGCATTGCACCATATTGTCTCTCGTCATCTTAAGATCACGAGAGACGATGAGGATGATGAGATCTGCTTCTACATCAACGGGAGGAACGTTGAGTTTACTCCGAGAGATTTCGCTCTCGTGACAGGATTGTCCTTTGGGGATGATCCTTTTGACCCCGAGGCTGAGCACGATCTGAGTCGGGCTCATACATTTAGACAATTTTGCCGCTCTCAACCGGTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809054.1
MMLDWQPGQKCNAALHHIVSRHLKITRDDEDDEICFYINGRNVEFTPRDFALVTGLSFGDDPFDPEAEHDLSRAHTFRQFCRSQPVSVRELADIYFDTVNPVVDTDGGLYLRVAHLLVLHAFVLGVDVRRPVQSWTWKLVDDLPAFSRFPWGSCAYRSLNYRLKHSTIKKDCKKYHFYGPSWALFIWGLEKIPYLGPAIAICNAGVYPRFRRWTFVKTKLDGLQSYFESPENGIWEMVPDEYEAKTSYWLSVAGVNAGIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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