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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003058`

染色体: Chr04 坐标: 47157978-47162720 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003058`
名称	SmilChr04G003058
描述	uncharacterized SmilChr04G003058
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47157978 - 47162720 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023854`
GeneID	`131023854`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023854`
原始查询	`SmilChr04G003058`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0221600; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os02g0221600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G67060` (AT1G67060) peptidase M50B-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843026] identity=80.4; qcov=1; evalue=8.38e-136; confidence=high
Rice	`Os02g0221600` - identity=79.6; qcov=1; evalue=3.91e-139; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13398 (Peptidase_M50B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023854

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057809453.1`
2	Lysosome	溶酶体	0.40000	`XP_057809453.1`
3	Endosome	内体	0.40000	`XP_057809453.1`
4	Endosome membrane	内体膜	0.40000	`XP_057809453.1`
5	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057809453.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47159926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr4:47160467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809453.1

235 aa

118

235

Peptidase_M50B

PF13398 Peptidase_M50B 26-224 aa

XP_057809454.1

235 aa

118

235

Peptidase_M50B

PF13398 Peptidase_M50B 26-224 aa

XP_057809455.1

235 aa

118

235

Peptidase_M50B

PF13398 Peptidase_M50B 26-224 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809453.1`	Pfam	`PF13398`	Peptidase_M50B	Family	26	224	2.5e-57	194.6	Peptidase M50B-like
`XP_057809454.1`	Pfam	`PF13398`	Peptidase_M50B	Family	26	224	2.5e-57	194.6	Peptidase M50B-like
`XP_057809455.1`	Pfam	`PF13398`	Peptidase_M50B	Family	26	224	2.5e-57	194.6	Peptidase M50B-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953472.1
CACTGCAACGAATTTACCATTTCTCATTTTTGTTGTTGCCGGTGCCAGTTAGGACACCAACTCTGTAGATTCCGCATAATTTGGACATATTCAACATTTCACCAAAATTGTTCTCTTCTTTAAGCAATTGGGCTCTTGTTTTTCCTTACGTTTCATTCGTCAATGCACAATTCTTAATTTCATAAGTCATAACTGTTTACTTATTCAAACTTTCCTCTTCTCCTTTCCTATTCTTTTCGGAGAAAAAAGAACATTCACAT...

XM_057953470.1
TTACCATTTCTCATTTTTGTTGTTGCCGGTGCCAGTTAGGACACCAACTCTGTAGATTCCGCATAATTTGGACATATTCAACATTTCACCAAAATTGTTCTCTTCTTTAAGCAATTGGGCTCTTGTTTTTCCTTACGTTTCATTCGTCAATGCACAATTCTTAATTTCATAAGTCATAACTGTTTACTTATTCAAACTTTCCTCTTCTCCTTTCCTATTCTTTTCGGAGAAAAAAGAACATTCACATAGAGAATGGTGGA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131023854
ATGGTGGATCCGAACTGGGAGCTGAAGAATTGCTGTCAGCACGAACAAGTTGTGTTTCTTGTTGCAATTGGCGTCTTCACTCTTGTTATTCTTGCTCTCTGGAGGACATTTCTTCTGACACCTTTTAAGCTCATCACTGTATTTCTTCATGAAGTGAGCCATGCAATTGCATGTAAGCTTACATGTGGTCAGGTAGAAGGTATCCAGGTTCACGCAAATGAAGGTGGCGTCACTCAAACACGCGGTGGTATATATTGGCT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057809453.1
MVDPNWELKNCCQHEQVVFLVAIGVFTLVILALWRTFLLTPFKLITVFLHEVSHAIACKLTCGQVEGIQVHANEGGVTQTRGGIYWLILPAGYIGSSFWGMVLVLASTKLLTARIAAGCLILALVIVFFIAKNWTLRGLCIGFIVFIAIIWVLQETTKVRILRYVILFIGVMNSLFSVYDIYDDLISRRVNSSDAEKFAELCPCPCNGAAWGVIWGIISFIFLSGSIYLGLVILS

XP_057809454.1
MVDPNWELKNCCQHEQVVFLVAIGVFTLVILALWRTFLLTPFKLITVFLHEVSHAIACKLTCGQVEGIQVHANEGGVTQTRGGIYWLILPAGYIGSSFWGMVLVLASTKLLTARIAAGCLILALVIVFFIAKNWTLRGLCIGFIVFIAIIWVLQETTKVRILRYVILFIGVMNSLFSVYDIYDDLISRRVNSSDAEKFAELCPCPCNGAAWGVIWGIISFIFLSGSIYLGLVILS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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