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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003081`

染色体: Chr04 坐标: 47408398-47410610 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003081`
名称	SmilChr04G003081
描述	putative glucose-6-phosphate 1-epimerase
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47408398 - 47410610 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023876`
GeneID	`131023876`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023876`
原始查询	`SmilChr04G003081`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative glucose-6-phosphate 1-epimerase
产物	putative glucose-6-phosphate 1-epimerase
Arabidopsis	`AT5G66530` (AT5G66530) Galactose mutarotase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836785] identity=70.1; qcov=0.967; evalue=4.51e-147; confidence=high
Rice	`Os09g0327400` - identity=69.3; qcov=0.967; evalue=4.88e-138; confidence=high
GO	GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0016853 (isomerase activity); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01263 (Aldose_epim)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023876

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057809494.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809494.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809494.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809494.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809494.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47408652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B81,C21,C6
`Chr4:47409331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr4:47410267`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B45,B83,C26
`Chr4:47410267`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B45,B83,C26
`Chr4:47410270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B83,C26
`Chr4:47410271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr4:47410274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B83,C26
`Chr4:47410308`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A7,A9,B111,B12,B121,B134,B17,B29,B35,B45,B55,B60,B77,B97,C11,C23,C5,C52,C69,C72,C84,D2,D8
`Chr4:47410334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809494.1

273 aa

136

273

Aldose_epim

PF01263 Aldose_epim 20-269 aa

XP_057809495.1

273 aa

136

273

Aldose_epim

PF01263 Aldose_epim 20-269 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809494.1`	Pfam	`PF01263`	Aldose_epim	Family	20	269	2.1e-43	149.6	Aldose 1-epimerase
`XP_057809495.1`	Pfam	`PF01263`	Aldose_epim	Family	20	269	2.1e-43	149.6	Aldose 1-epimerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953512.1
TATATATAATACATGTCACACAAAATACACAATCAATAATGGAGTGGTCAAGCGTAAATGGGTTGGGAAATCTACCAAAGATCATCTTAACTTGTATGGACGGAAGTGAGGCAGAGGTATATCTATATGGAGGCTGTGTTACATCCTGGAAAATAGATGCCAAAGATGTTCTTTATCTTCGTCCCGACGCCATATTTAGCGGTGAGAAGCCGATTAGTGGAGGAATACCACATTGTTTGCCACAGTTTGGACCTGGCCCA...

XM_057953511.1
AATTAAGAGCGAAAAAGCGGAGAAAGGTGATACTGATACGGATGCATTGAATATCCGACTTCACTTTCTTTTCGCTTATAATCTACGCAACTCACTATATATAATACATGTCACACAAAATACACAATCAATAATGGAGTGGTCAAGCGTAAATGGGTTGGGAAATCTACCAAAGATCATCTTAACTTGTATGGACGGAAGTGAGGCAGAGGTATATCTATATGGAGGCTGTGTTACATCCTGGAAAATAGATGCCAAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131023876
ATGGAGTGGTCAAGCGTAAATGGGTTGGGAAATCTACCAAAGATCATCTTAACTTGTATGGACGGAAGTGAGGCAGAGGTATATCTATATGGAGGCTGTGTTACATCCTGGAAAATAGATGCCAAAGATGTTCTTTATCTTCGTCCCGACGCCATATTTAGCGGTGAGAAGCCGATTAGTGGAGGAATACCACATTGTTTGCCACAGTTTGGACCTGGCCCATTGCAGCAGCATGGATTCGCAAGGAACATGGAGTGGTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809494.1
MEWSSVNGLGNLPKIILTCMDGSEAEVYLYGGCVTSWKIDAKDVLYLRPDAIFSGEKPISGGIPHCLPQFGPGPLQQHGFARNMEWSIVSVENMQINPCVTLELKDNPYSRSMWDYGFHALYKVTLGTHTLSTEIKITNTDQIPFSFTTALHTYFRASAAEASVKYLNGCKTLNKQPDPKNPVEGKEERDVVTFPGFVDCIYLDAPDELHLDNGLGDSITIRNTNWSDVVLWNPYLTMESCYKDFVCVENAKIGEVELQP...

XP_057809495.1
MEWSSVNGLGNLPKIILTCMDGSEAEVYLYGGCVTSWKIDAKDVLYLRPDAIFSGEKPISGGIPHCLPQFGPGPLQQHGFARNMEWSIVSVENMQINPCVTLELKDNPYSRSMWDYGFHALYKVTLGTHTLSTEIKITNTDQIPFSFTTALHTYFRASAAEASVKYLNGCKTLNKQPDPKNPVEGKEERDVVTFPGFVDCIYLDAPDELHLDNGLGDSITIRNTNWSDVVLWNPYLTMESCYKDFVCVENAKIGEVELQP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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