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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003087`

染色体: Chr04 坐标: 47471279-47472584 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003087`
名称	SmilChr04G003087
描述	uncharacterized SmilChr04G003087
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47471279 - 47472584 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023529`
GeneID	`131023529`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023529`
原始查询	`SmilChr04G003087`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=24.6; qcov=1.09; evalue=2.72e-27; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=26.9; qcov=1.16; evalue=3.29e-34; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023529

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057809057.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057809057.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809057.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809057.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809057.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47471287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr4:47471291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C11,C53,C69,D11,D7
`Chr4:47471298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B44,B47,C16
`Chr4:47471299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B44,B47,C16
`Chr4:47471310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B140
`Chr4:47471322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B140
`Chr4:47471325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr4:47471343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B24,D11
`Chr4:47471358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C16,C80,C84,C87
`Chr4:47471359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	59	A1,A16,A21,A23,A25,B10,B101,B103,B105,B112,B120,B122,B126,B128,B129,B134,B136,B137,B139,B16,B18,B2,B23,B3,B30,B33,B40,B42,B43,B48,B66,B69,B71,B75,B77,B8,B80,B84,C1,C10,C16,C18,C22,C24,C26,C27,C28,C37,C40,C42,C47,C63,C64,C70,C79,C87,D11,D7,D9
`Chr4:47471364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C61,C84
`Chr4:47471405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809057.1

360 aa

180

360

MULE

PF10551 MULE 32-82 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809057.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	32	82	1.4e-07	32.5	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953074.1
ATGGATTTGGAAGTAGACGAAAACAACCGGTTCAAACATCTGTTTCTTGCTCTTGCGGCTTCCATCACACCTTTCTTCTTTTCGCTTCGACCAGTGATTGTGGTCGACGGCACACACTTGAAGGGGAAGAACAATGGTATTTTGTTCGTCGCCGTGACAAAAGACGCAAACGAGCAAGTTTTTCCGTTGGCATTTGGTGCCGGGCCGATCGAGAATGATGAGTCATGGAAGTGGTTCCTCTCAAATAACAAAATTAAGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023529
ATGGATTTGGAAGTAGACGAAAACAACCGGTTCAAACATCTGTTTCTTGCTCTTGCGGCTTCCATCACACCTTTCTTCTTTTCGCTTCGACCAGTGATTGTGGTCGACGGCACACACTTGAAGGGGAAGAACAATGGTATTTTGTTCGTCGCCGTGACAAAAGACGCAAACGAGCAAGTTTTTCCGTTGGCATTTGGTGCCGGGCCGATCGAGAATGATGAGTCATGGAAGTGGTTCCTCTCAAATAACAAAATTAAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809057.1
MDLEVDENNRFKHLFLALAASITPFFFSLRPVIVVDGTHLKGKNNGILFVAVTKDANEQVFPLAFGAGPIENDESWKWFLSNNKIKGYGQAVVEFFRQAAYAYTDSEFSRAMSAMAQLKPAAYGKLMRVGPEKWARSQSPVTRYSFLTSNAAEALNARLLWARRLPICSMLEAIRMVLEQWFNDRLASAEESDDLLTPEATQKISAEISKCRRYTAKRTSERKYRVRAGDRRFMVDLQAKSCECNEFDMDGMPLRRKSQW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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