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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003090`

染色体: Chr04 坐标: 47527776-47531610 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003090`
名称	SmilChr04G003090
描述	uncharacterized SmilChr04G003090
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47527776 - 47531610 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023530`
GeneID	`131023530`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023530`
原始查询	`SmilChr04G003090`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0672600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0672600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=22.8; qcov=0.496; evalue=3.47e-11; confidence=weak
Rice	`Os11g0672600` - identity=34; qcov=0.417; evalue=1.47e-34; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023530

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809058.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057809058.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057809058.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809058.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809058.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47527789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B40,B89,C19,C21,C27,C31,C80,D9
`Chr4:47527801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B83,D3
`Chr4:47527812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B38,C13,C67
`Chr4:47527813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr4:47527817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C9
`Chr4:47527826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C38
`Chr4:47527829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B52,B68,C38
`Chr4:47527881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr4:47527893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B133,B88,C53
`Chr4:47527899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,C67
`Chr4:47527942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	29	B104,B115,B127,B130,B20,B37,B41,B5,B56,B63,B67,B70,B78,B79,B90,B92,B94,B96,C13,C2,C3,C40,C44,C53,C62,C70,C83,C87,D11
`Chr4:47527946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,C1,C43,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809058.1

585 aa

292

585

RVT_1

zf-RVT

PF00078 RVT_1 99-213 aa PF13966 zf-RVT 488-582 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809058.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	99	213	7.3e-20	72.4	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057809058.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	488	582	9.7e-18	65.3	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953075.1
ATGGAGAGCCAAGGGAAGAAAAGGAGGAGTCTACCGAAATTGCCAAATGACTTCACGGCAAGATCACTATCTGCAGAGGATAAGAGAAGGTTAATTAGACCTTTTACCGAAGAAGAAGCAAAAGAGGCAGTGTGGAGCTGCGACGAAAGCAAGAGTCCAGGCCCGGATGGATTCAACTTGTGCTTCTGGAAATCCTCATGGGAAGTGATTAAAGGTGATTTTATCAAACTGCTCCAGGAGTTCCATGAAAATGGGAAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023530
ATGGAGAGCCAAGGGAAGAAAAGGAGGAGTCTACCGAAATTGCCAAATGACTTCACGGCAAGATCACTATCTGCAGAGGATAAGAGAAGGTTAATTAGACCTTTTACCGAAGAAGAAGCAAAAGAGGCAGTGTGGAGCTGCGACGAAAGCAAGAGTCCAGGCCCGGATGGATTCAACTTGTGCTTCTGGAAATCCTCATGGGAAGTGATTAAAGGTGATTTTATCAAACTGCTCCAGGAGTTCCATGAAAATGGGAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809058.1
MESQGKKRRSLPKLPNDFTARSLSAEDKRRLIRPFTEEEAKEAVWSCDESKSPGPDGFNLCFWKSSWEVIKGDFIKLLQEFHENGKIPKGGNSSFITLIPKKEEACSLDDYRPISLIGSIYKVIAKILAQRLSAVMDSIISENQSAFIKGRFILDGVVILSEVIEEAKREKNGRMIFKIDFAKAYDSVEWDFIDSMLERFNFDPLWRRWMKGRLSSASANVLINGSPSDNEKNADVVKKILSLFELLSGLKVNYSKSSLM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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