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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003096`

染色体: Chr04 坐标: 47574662-47576809 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003096`
名称	SmilChr04G003096
描述	60S ribosomal protein L6, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47574662 - 47576809 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023890`
GeneID	`131023890`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023890`
原始查询	`SmilChr04G003096`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L6, mitochondrial-like
产物	60S ribosomal protein L6%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT2G18400` (AT2G18400) ribosomal protein L6 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816355] identity=90.3; qcov=0.912; evalue=1.35e-58; confidence=high
Rice	`Os03g0725000` (OsRpl6-1) - identity=80.6; qcov=0.912; evalue=4.86e-53; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0019843 (rRNA binding)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00347 (Ribosomal_L6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023890

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809513.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057809513.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057809513.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809513.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809513.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809513.1

102 aa

102

Ribosomal_L6

PF00347 Ribosomal_L6 17-88 aa

XP_057809514.1

102 aa

102

Ribosomal_L6

PF00347 Ribosomal_L6 17-88 aa

XP_057809515.1

102 aa

102

Ribosomal_L6

PF00347 Ribosomal_L6 17-88 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809513.1`	Pfam	`PF00347`	Ribosomal_L6	Domain	17	88	1.4e-18	68.1	Ribosomal protein L6
`XP_057809514.1`	Pfam	`PF00347`	Ribosomal_L6	Domain	17	88	1.4e-18	68.1	Ribosomal protein L6
`XP_057809515.1`	Pfam	`PF00347`	Ribosomal_L6	Domain	17	88	1.4e-18	68.1	Ribosomal protein L6

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953531.1
AAATCATCACTAAATTAATAAATAAGCCCAACAACTATCTTATGCTATCTAAACCCATTAGAAATATTAATAGGCCTATCAAAACTTCAGGCCCAGTATTTTGCAAGCCCAATTAGATTAAATAAATAAAACAAATTTTCTTAAAAAGAAAGCAGATTAATCTCTCTCTATCATTTACGTAAATTCTCTCTATTTCTGCGTTCTCTCTCTTTCTCTGCTCTTTACCGTCCCTTTCTCTCTCCCTTCGCCCCTCTCTGCCG...

XM_057953530.1
GCAGATTAATCTCTCTCTATCATTTACGTAAATTCTCTCTATTTCTGCGTTCTCTCTCTTTCTCTGCTCTTTACCGTCCCTTTCTCTCTCCCTTCGCCCCTCTCTGCCGGCTCCCTTCTTCCCCATCTCACCGGGACGTCGCTGGTTCTCGCCGCCTCCGGCGCGGCGAGGCAGGCCCCTGTTCTTCCCCCTTCTTCCTTTATCTTCTCTTCCCCCAATTTCCCAGGCTACCACTACTTAGGGTTTTGAAGTTTCCTCTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131023890
ATGGAAGCCAAATTCTTCCGCTTTCTTAAGATTGTTGGAGTTGGTTTCAAAGCAAGAGCAGAGGCTGAAGGCCGTCTCTTATACCTAAAGCTTGGTTATAGCCATGAGGTGGAACTGGCTGTGCCTCCTGCAGTTCGTGTATTCTGCTTCAAAAACAATGTAGTATGCTGCACCGGGATTGACAAGGACAGGGTGCATCAATTTGCTGCTGCTGTTCGTAGTTGTAAGCCCCCTGAGGTCTACAAAGGCAAAGGTATTAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057809513.1
MEAKFFRFLKIVGVGFKARAEAEGRLLYLKLGYSHEVELAVPPAVRVFCFKNNVVCCTGIDKDRVHQFAAAVRSCKPPEVYKGKGIMYIDEVIKKKEGKRSK

XP_057809514.1
MEAKFFRFLKIVGVGFKARAEAEGRLLYLKLGYSHEVELAVPPAVRVFCFKNNVVCCTGIDKDRVHQFAAAVRSCKPPEVYKGKGIMYIDEVIKKKEGKRSK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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