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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003097`

染色体: Chr04 坐标: 47577940-47579131 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003097`
名称	SmilChr04G003097
描述	uncharacterized SmilChr04G003097
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47577940 - 47579131 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023891`
GeneID	`131023891`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023891`
原始查询	`SmilChr04G003097`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dessication-induced 1VOC superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745745]; symbol=DSI-1VOC; hit=AT1G07645; species=arabidopsis; confidence=high
产物	dessication-induced 1VOC superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745745]; symbol=DSI-1VOC; hit=AT1G07645; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G07645` (DSI-1VOC) dessication-induced 1VOC superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745745] identity=76.6; qcov=1.03; evalue=1.3e-74; confidence=high
Rice	`Os03g0277500` (OsGLYI3) - identity=68.4; qcov=1; evalue=2.38e-65; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00903 (Glyoxalase); PF12681 (Glyoxalase_2); PF18029 (Glyoxalase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023891

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057809516.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809517.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057809517.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809516.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809516.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47578642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr4:47578713`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A2,B121,B17,B55,B60,B91,B97,B98,C26,C69,C72,C84,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809516.1

154 aa

154

Glyoxalase

PF00903 Glyoxalase 10-92 aa

XP_057809517.1

133 aa

133

Glyoxalase

Glyoxalase_2

Glyoxalase_6

PF00903 Glyoxalase 10-126 aa PF12681 Glyoxalase_2 11-129 aa PF18029 Glyoxalase_6 13-122 aa

XP_057809518.1

133 aa

133

Glyoxalase

Glyoxalase_2

Glyoxalase_6

PF00903 Glyoxalase 10-126 aa PF12681 Glyoxalase_2 11-129 aa PF18029 Glyoxalase_6 13-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809516.1`	Pfam	`PF00903`	Glyoxalase	Domain	10	92	7.7e-07	30.2	Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily
`XP_057809517.1`	Pfam	`PF00903`	Glyoxalase	Domain	10	126	3.3e-15	57.2	Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily
`XP_057809517.1`	Pfam	`PF12681`	Glyoxalase_2	Domain	11	129	2.8e-11	44.1	Glyoxalase-like domain
`XP_057809517.1`	Pfam	`PF18029`	Glyoxalase_6	Domain	13	122	4e-11	44.2	Glyoxalase-like domain
`XP_057809518.1`	Pfam	`PF00903`	Glyoxalase	Domain	10	126	3.3e-15	57.2	Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily
`XP_057809518.1`	Pfam	`PF12681`	Glyoxalase_2	Domain	11	129	2.8e-11	44.1	Glyoxalase-like domain
`XP_057809518.1`	Pfam	`PF18029`	Glyoxalase_6	Domain	13	122	4e-11	44.2	Glyoxalase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953535.1
GCGAGGGAGTAATGACATCCAACTTGAAGCCGGCGTATGCATACACGGTTGTGTACGTGAAAGATGTGGCCAAATCTGTCGACTTCTACGCCAAGGCCTTGGGCTACAACGTCCGCCGCCTCCACGATTCTCACAGATGGGGGGAGCTGGAGAGCGGCTCCACAACGATAGCGTTTACGCCGGCGAAGCAACATGAGACGGACGACCTCACCGGGAGCGTCAAGATCCGCGACAGAAATCCTGTGGAGGTTTGCTTTGAT...

XM_057953534.1
GCGAGGGAGTAATGACATCCAACTTGAAGCCGGCGTATGCATACACGGTTGTGTACGTGAAAGATGTGGCCAAATCTGTCGACTTCTACGCCAAGGCCTTGGGCTACAACGTCCGCCGCCTCCACGATTCTCACAGATGGGGGGAGCTGGAGAGCGGCTCCACAACGATAGCGTTTACGCCGGCGAAGCAACATGAGACGGACGACCTCACCGGGAGCGTCAAGATCCGCGACAGAAATCCTGTGGAGGTTTGCTTTGAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131023891
ATGACATCCAACTTGAAGCCGGCGTATGCATACACGGTTGTGTACGTGAAAGATGTGGCCAAATCTGTCGACTTCTACGCCAAGGCCTTGGGCTACAACGTCCGCCGCCTCCACGATTCTCACAGATGGGGGGAGCTGGAGAGCGGCTCCACAACGATAGCGTTTACGCCGGCGAAGCAACATGAGACGGACGACCTCACCGGGAGCGTCAAGATCCGCGACAGAAATCCTGTGGAGGTTTGCTTTGATTATGACGACGT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057809516.1
MTSNLKPAYAYTVVYVKDVAKSVDFYAKALGYNVRRLHDSHRWGELESGSTTIAFTPAKQHETDDLTGSVKIRDRNPVEVCFDYDDVDAAFKVCIFKSNNTINLDHDIGDHTITESGGEWGGGGGQAGGERVGPESGVRERYRWHRGQAGKPRT

XP_057809517.1
MTSNLKPAYAYTVVYVKDVAKSVDFYAKALGYNVRRLHDSHRWGELESGSTTIAFTPAKQHETDDLTGSVKIRDRNPVEVCFDYDDVDAAFKRAVENGAEAVAKPEEKEWGQKVGYVRDIDGIVVRLGSHVRS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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